Moleculaire diagnostiek voor identificatie primaire origine
Uitgangsvraag
Wat zijn de aanbevolen moleculaire bepalingen voor het opsporen van een primaire tumor
bij patiënten met voorlopige primaire tumor onbekend (PTO)?
De uitgangsvraag omvat de volgende deelvragen:
- Welke moleculaire analyses zijn beschikbaar die kunnen bijdragen aan het opsporen van de primaire origine?
- Welke test wordt geadviseerd om in te zetten?
Aanbeveling
Voor de plaats van moleculaire diagnostiek in het traject en de definitie voorlopige PTO, zie module Patiëntprofiel en diagnostische stratgie.
Indien het een patiënt betreft met een voorlopige PTO, waarbij ingeschat wordt dat de conditie therapie toelaat:
- Verricht WGS-analyse indien vriesmateriaal beschikbaar is of kan worden afgenomen met minimaal 20% neoplastische cellen.
- Verricht uitgebreide moleculaire analyse middels een uitgebreid DNA-panel (>1 Mb kankergerelateerde genen), bij voorkeur gecombineerd met uitgebreide RNA fusiegen-analyse, indien alleen bestaand FFPE of cytologisch materiaal beschikbaar is en/of het percentage neoplastische cellen te laag is in het vriesmateriaal (<20%).
- Informeer de patiënt vooraf dat er een mogelijkheid is tot het vinden van aanwijzingen voor een mogelijke erfelijke aanleg, zie voor verdere informatie en beleid:
Indien het een patiënt betreft met een voorlopige PTO, waarbij ingeschat wordt dat de conditie de meeste behandelingsmogelijkheden niet meer toelaat:
- Verricht geen moleculaire analyse omdat de voordelen niet opwegen tegen de nadelen.
Overwegingen
Voor- en nadelen van de verschillende moleculaire bepalingen en de kwaliteit van het bewijs
Het belangrijkste voordeel van het uitvoeren van een moleculaire test voor het bepalen van de primaire origine is dat wanneer een origine wordt gevonden, de patiënt volgens het protocol van het betreffende tumortype kan worden behandeld. Op deze manier krijgt de patiënt de meest passende behandeling en prognose. Tevens neemt het een beetje onrust bij patiënt en diens naaste(n) weg wanneer ze meer duidelijkheid hebben over de ziekte; dit zal bijdragen aan een betere kwaliteit van leven. Nadelen van het uitvoeren van een extra moleculaire test zijn:
- Soms zal een nieuw (vries)biopt moeten worden afgenomen wat zorgt voor extra belasting voor de patiënt. Daarnaast is dit soms niet mogelijk bij een matige conditie van de patiënt of lastig te bereiken locatie van de tumor.
- Er zal niet altijd een aanwijzing worden gevonden voor de primaire origine.
- De test zal extra directe kosten met zich meebrengen. Daar tegenover staat dat het uiteindelijk mogelijk weer kan leiden tot kostenbesparing, doordat bij het vinden van de primaire origine een passende behandeling kan worden gegeven en geen geld verloren gaat aan onjuiste behandeling/overbehandeling.
Bij het selecteren van een test kunnen de volgende factoren worden meegenomen:
- Beschikbaarheid van de test in Nederland (wordt de test in een Nederlands pathologie laboratorium aangeboden).
- De opbrengst van de test.
- Het type weefsel dat beschikbaar is / te verkrijgen is bij de patiënt.
- Het tegelijkertijd kunnen gebruiken van de test voor het identificeren van therapietargets.
In de literatuursamenvatting zijn 16 studies opgenomen die rapporteren over de opbrengst van de verschillende testen. Deze artikelen kunnen een indicatie geven van de te verwachten opbrengst. Er zijn echter vrijwel geen vergelijkende studies beschikbaar die de keuze voor een test kunnen onderbouwen.
Met de testen die op dit moment beschikbaar zijn in Nederlandse pathologie laboratoria, WGS of uitgebreide DNA + RNA panels, zal naar alle waarschijnlijkheid een aanwijzing voor de origine kunnen worden gevonden in >40% van de patiënten (Moon, 2023; Schipper, 2022). Het voordeel is dat deze testen tegelijkertijd gebruikt kunnen worden voor het identificeren van therapietargets.
Daarnaast kunnen andere testen als expressie profiling en methylatie profiling mogelijk een aanwijzing geven voor de primaire origine. Deze testen zijn echter (nog) niet beschikbaar in Nederland voor PTO-vraagstellingen. Uitsturen naar het buitenland zou mogelijk zijn, echter wordt dit niet geadviseerd omdat 1) dit zal zorgen voor langere doorlooptijden en 2) deze testen minder goed in staat zijn om therapietargets te detecteren.
De meerwaarde van reguliere (‘site-directed’) behandeling bij een voorlopige PTO-patiënt waarbij de primaire origine gevonden is met behulp van moleculaire diagnostiek, is nog onduidelijk; sommige studies tonen geen meerwaarde aan, terwijl andere studies wel een gunstig effect laten zien, waaronder de gerandomiseerde fase 2 CUPISCO studie (Hayashi, 2019; Hainsworth, 2012; Ding, 2022); De origine is in deze studies veelal bepaald met expressie profiling of methylatie profiling. Meer onderzoek is nodig om de meerwaarde in kaart te brengen van gerichte behandeling na het vinden van de primaire origine met WGS of uitgebreide DNA en RNA-analyses.
Waarden en voorkeuren van patiënten (en evt. hun naasten)
Het is wenselijk om tot een gezamenlijke beslissing te komen met patiënt en naaste(n) met betrekking tot zorg, diagnostiek (waaronder moleculaire analyse voor het bepalen van de primaire origine) en behandeling, met daarbij in acht nemend de behandelwensen van de patiënt. Ook kan gezamenlijk worden besproken of een patiënt fysiek naar een specialistisch centrum voor PTO wil worden doorverwezen of dat de casus daar alleen wordt besproken inclusief het inzetten van moleculaire diagnostiek en bespreken van de resultaten hiervan. Gezien het veelal snelle ziektebeloop, heeft het de voorkeur dat de moleculaire diagnostiek zo snel mogelijk en eventueel gelijktijdig wordt ingezet met andere aanvullende diagnostiek. Voor patiënten met lage gezondheidsvaardigheden is het moeilijk om in te schatten wat de voor- en nadelen zijn van een moleculaire test. Een goed gesprek waarin uitleg gegeven wordt over de moleculaire test, inclusief de mogelijkheid tot het vinden van mogelijke aanwijzing voor erfelijke aanleg is daarom erg belangrijk. Zie voor verdere informatie en beleid: (1) De richtlijn informeren en informed consent bij uitgebreide moleculaire diagnostiek, (2) Leidraad voor verwijzing na DNA onderzoek in (tumor)weefsel. In dit gesprek moet tevens genoeg ruimte zijn voor patiënt en naaste(n) om vragen te stellen en twijfels te bespreken. Uiteraard zal er bij keuzes rekening gehouden worden met de wensen van de patiënt met betrekking tot geloofsovertuigingen.
Samengevat moeten de volgende onderwerpen minimaal met de patiënt worden besproken:
- Doorsturen naar een gespecialiseerd centrum
- Informatie over beloop van het diagostisch en behandeltraject
- Eventueel inzetten van aanvullende diagnostiek, waaronder moleculaire diagnostiek
- Kans op vinden van aanwijzingen voor erfelijke aanleg
Kosten (middelenbeslag)
Aangezien de prognose voor patiënten met PTO doorgaans slecht is, is het van belang om zo snel mogelijk de therapiemogelijkheden in kaart te brengen. Voor patiënten met PTO kan het identificeren van de origine en het vinden van mogelijke aanknopingspunten voor doelgerichte therapie beide leiden tot een betere (op maat) behandeling voor de patiënt. Kostentechnisch is het het meest wenselijk om zowel de origine als therapie-targets met 1 test te kunnen onderzoeken. De kosten van WGS en een combinatie van een uitgebreid DNA + RNA panel liggen ongeveer in dezelfde orde van grootte. De verwachting is dat de kosten voor sequencing de komende jaren zullen afnemen.
Voor de patiënten waarbij de conditie zo slecht is dat ze waarschijnlijk niet meer in aanmerking komen voor de meeste behandelingsmogelijkheden, wegen de voordelen mogelijk niet op tegen de nadelen (extra kosten, afname vriesbiopt indien nodig) en wordt dan ook geadviseerd om geen extra moleculaire analyses in te zetten. Dit zal uiteraard met patiënt en naasten worden besproken.
Aanvaardbaarheid, haalbaarheid en implementatie
Uitgebreide moleculaire DNA en RNA-analyses worden in steeds meer (grotere) Nederlandse pathologie-laboratoria standaard uitgevoerd. Daarnaast kan WGS uitgevoerd worden; deze test wordt door de zorgverzekeraar vergoed voor patiënten met PTO. WGS is de meest uitgebreide moleculaire test waarbij middels een ingebouwde predictie-tool (CUPPA) een uitspraak wordt gedaan over de mogelijke primaire origine. Met name de mogelijkheid om deze predictie-tool toe te kunnen passen, maakt dat WGS de voorkeur heeft over andere brede DNA-panels. Voor WGS moet bloed en vers ingevroren weefsel (fresh frozen) met minimaal 20% neoplastische cellen beschikbaar zijn om de analyse uit te voeren. Indien vers ingevroren weefsel beschikbaar is, blijkt WGS in 93% van de gevallen succesvol te kunnen worden uitgevoerd (van Putten, 2023). Vers ingevroren weefsel zal echter niet voor alle patiënten beschikbaar zijn, en soms is extra afname van vers weefsel niet mogelijk vanwege de locatie van de tumor en/of conditie van de patiënt. Indien er enkel bestaand FFPE of cytologisch materiaal beschikbaar is, kan gebruik worden gemaakt van andere uitgebreide DNA-panels met kankergerelateerde genen (>1Mb) of whole exome sequencing (WES), bij voorkeur gecombineerd met een uitgebreide RNA-analyse om een breed scala aan (tumor-type specifieke) fusiegenen te kunnen detecteren. Ondanks dat de CUPPA predictie-tool niet kan worden toegepast, kunnen de resultaten van deze uitgebreide DNA en RNA-analyses op basis van literatuur, en in combinatie met de pathologie en kliniek (met name beeldvorming), aanknopingspunten geven voor de primaire origine. Vanuit de ziekenhuizen zonder PTO zorgpad en Moleculaire Tumor Board, zullen PTO-patiënten bij een specialistisch centrum kunnen worden aangemeld en/of besproken, waarna binnen het PTO zorgpad kan worden bepaald of en welke moleculaire analyse zal worden ingezet.
Rationale van de aanbeveling: weging van argumenten voor en tegen de interventies
Bij het formuleren van aanbevelingen is met name rekening gehouden met de beschikbaarheid van verschillende testen in Nederland. Daarnaast is er ook rekening gehouden met het type materiaal dat beschikbaar is voor de analyse; vriesweefsel zal niet voor alle patiënten beschikbaar zijn, dus is er ook gekeken naar testen geschikt voor bestaand FFPE/cytologisch materiaal. Indien vriesmateriaal beschikbaar is heeft WGS de voorkeur boven andere brede DNA panels, omdat middels de ingebouwde predictie-tool (CUPPA) een uitspraak kan worden gedaan over de mogelijke primaire origine. Om de kosten acceptabel te houden is meegewogen dat bij voorkeur testen worden gebruikt waarbij ook therapietargets kunnen worden geïdentificeerd. Tevens is er rekening gehouden met de conditie van de patiënt; indien de conditie zo slecht is dat een patiënt waarschijnlijk niet meer in aanmerking komt voor de meeste behandelingsmogelijkheden, wegen de voordelen niet op tegen de nadelen (extra kosten, afname nieuw (vries)biopt indien nodig).
Onderbouwing
Achtergrond
Op dit moment is er nog veel praktijkvariatie wat betreft moleculaire diagnostiek voor PTO-patiënten in Nederland. Voor een deel van de patiënten zal geen moleculaire analyse worden verricht, soms wordt een klein Next-Generation Sequencing (NGS) panel gedaan en voor een selectie van patiënten wordt er gebruik gemaakt van uitgebreide DNA en RNA-gebaseerde NGS-panels of Whole Genome Sequencing (WGS). Uitgebreide moleculaire testen zijn de laatste jaren in veel laboratoria geïmplementeerd en worden dan ook steeds vaker toegepast. Daarnaast kunnen andere testen als expressieprofiling en methylatieprofiling mogelijk ook een aanwijzing geven voor een primaire origine. De meerwaarde en beschikbaarheid van deze verschillende testen die kunnen bijdragen bij het bepalen van de primaire origine is nog onvoldoende in kaart gebracht. Zie module Patiëntprofiel en diagnostische strategie voor de plaats van brede moleculaire diagnostiek in het diagnostische traject bij patiënten met PTO. Zie module Biomarkers/targets voor doelgerichte behandeling en behandeling met immuuncheckpointremmers voor moleculaire diagnostiek t.b.v. behandeltargets.
Conclusies / Summary of Findings
|
There are indications that comprehensive molecular analyses (gene-expression based assays, micro-RNA based expression assays, DNA sequencing assays, and DNA methylation assays) can identify the primary origin in the majority of patients with provisional cancer of unknown primary where the initial diagnostic work up has not led to the identification of the primary tumor.
Sources: Greco, 2010; Greco, 2013; Greco, 2015; Hainsworth, 2013; Möhrmann, 2022; Monzon, 2010; Moran, 2016; Morawietz, 2010; Pentheroudakis, 2013; Posner, 2023; Schipper, 2022; Thomas, 2018; Qi, 2022; Varadhachary, 2011; Vibert, 2021; Ye, 2020 |
Samenvatting literatuur
International guidelines
In the current national and international guidelines for CUP, advice on performing molecular analyses to identify the primary origin is often lacking or only briefly described. In the Dutch CUP guideline from 2012 it was mentioned that RNA expression profiling could help to identify the primary origin, however this was not yet recommended because the applicability was unclear. In several international guidelines molecular analyses are briefly mentioned. In the ‘NCCN Guideline - Occult primary (2021)’, and the ‘NICE Clinical guideline - Metastatic malignant disease of unknown primary origin (2010-2017)’ it is mentioned that gene expression profiling may help to identify the primary origin. Both guidelines mention that the clinical benefit is still unclear, therefore the NICE guideline only recommends gene expression profiling in a research setting. In the ‘SEOM 2021 guideline (from Spain)’ (Losa, 2022) gene expression, microRNA expression and methylation profiling are described as possible techniques to identify the primary tumor. However, in their recommendations they mention that molecular profiling is recommended not so much to identify the most likely primary tumor, but to characterize genomic alterations (using mutation profiling) that may be associated with personalized targeted therapy. In the ‘clinical practice guidance for NGS in clinical cancer diagnosis and treatment - 2018’ from Japan (Sunami, 2018), a general statement is made (not specifically for CUP) that NGS gene panels can help to support the diagnosis.
Results
Question 1 ‘Which molecular analyses are available to identify the tissue of origin?’
Description of studies
The review by Rassy (2020) includes an overview of the different assays developed to identify the tissue of origin. This overview was adapted based on the results from our systematic search, using the overviews in the reviews combined with the information from the selected original studies.
Table 1 shows an overview of molecular tests that can help to identify the primary origin. For each test, the table also indicates which tissue type can be used and whether the test is available in the Netherlands for CUP.
Results
Table 1. Overview of molecular tests available to predict the primary origin (based on Table 3 in Rassy 2020 in combination with information from original articles)
|
Method* |
Type of tissue |
Analyte |
References |
Available in NL for CUP |
|
Gene expression profiling (whole transcriptome) |
FF |
RNA |
Vibert, 2021; Möhrmann, 2022 |
No (only for childhood cancers) |
|
Gene expression profiling (gene panel) |
FF / FFPE |
RNA |
Qi, 2022; Ye, 2020; Thomas, 2018; Greco, 2010; Greco, 2013, Greco, 2015; Hainsworth, 2013; Monzon, 2010; Morawietz, 2010; Posner, 2023 |
No |
|
miRNA expression profiling (panel) |
FF / FFPE |
miRNA |
Pentheroudakis, 2013; Varadhachary, 2011 |
No |
|
Methylation profiling |
FF / FFPE |
DNA |
Moran, 2016; Möhrmann, 2022 |
No (only for classifying specific tumor types e.g. sarcoma, central nervous system tumors) |
|
NGS RNA-based fusion gene-analysis |
FF / FFPE / cytology |
RNA |
expert opinion. e.g. Archer |
Yes |
|
NGS DNA-analysis (gene panel > 1Mb) |
FF / FFPE / cytology |
DNA |
Posner, 2023; Moon, 2023# |
Yes |
|
Whole exome sequencing (WES) |
FF / FFPE / cytology |
DNA |
Expert opinion |
Yes |
|
Whole genome sequencing (WGS) |
FF |
DNA |
Schipper 2022 |
Yes |
|
* Different bio-informatic algorithms can be used to classify the tumor using the obtained data # Published after literature search |
|
|
|
|
Abbreviations:
CUP, cancer of unknown primary;
FF, fresh frozen;
FFPE, formalin-fixed paraffin-embedded;
miRNA, microRNA;
Question 2 ‘Which molecular analysis should be used for a particular patient?’
Description of studies
Sixteen studies were included in the analysis of the literature. These studies reported on the diagnostic yield in terms of indication for primary origin found. Studies were divided into five categories, based on the type of comprehensive molecular analysis used:
- Gene-expression based assays (n=10)
- Micro-RNA based assays (n=2)
- DNA sequencing assays (n=1)
- DNA methylation assays (n=1)
- Combination or comparison of different assays (n=2)
Important study characteristics and results are summarized in Table 2.
Results
Most studies reported results for one type of analysis, and showed that the origin could be identified in the majority of patients. The study by Posner (2023) compared the results from RNA and DNA tests and concluded that DNA sequencing was more informative than gene expression profiling (GEP).
1.1 Gene-expression based assays
Ten studies reported results for indication of primary origin using gene-expression based assays (Qi, 2022; Vibert, 2021; Ye, 2020; Thomas, 2018; Greco, 2015; Greco, 2013; Hainsworth, 2013; Greco, 2010; Monzon, 2010; Morawietz, 2010). These studies included a total of 1288 patients (range 21-444) and were conducted in China (n=2), the USA (n=6), France (n=1) and Germany (n=1).
The proportion of patients with reportable results ranged from 71% to 100%. In one study, the analysis was performed two to five years after biopsies were taken, resulting in a lower proportion of patients with reportable results (57%). Among patients with reportable results, the proportion of patients for whom the test resulted in an indication for primary origin ranged between 76-100% (Qi, 2022; Vibert, 2021; Thomas, 2018; Greco, 2015; Greco, 2013; Hainsworth, 2013; Greco, 2010; Monzon, 2010). Results were consistent or compatible with clinicopathologic features in 72% of patients (Ye, 2020) and 62% of patients (Monzon, 2010). In 15/20 patients (75%), predictions were correct, corresponding to the actual latent primary sites identified after the initial diagnosis of CUP (Greco, 2010). In 11 out of 16 patients, additional immunohistochemistry (IHC) and genetic testing supported the diagnosis provided by the molecular cancer classifier assay (Greco, 2015). In 13/24 patients (54%), IHC and GEP yielded the same indication for primary origin that was also supported by the clinical findings (Morawietz, 2010).
2.2 Micro-RNA based assays
Two studies reported results for indication of primary origin using micro-RNA based assays (Pentheroudakis, 2013; Varadhachary, 2011). These studies included 92 and 87 patients, for a total of 179 patients, and were conducted in Greece and the USA.
The proportion of patients with reportable results was 85% and 91%, respectively. In one study, results from the microRNA based assay was in accordance with the clinical diagnosis after patient management in 70% of patients, and was in accordance with the final clinical diagnosis reached with supplemental immunohistochemical stains in 92% of patients (Pentheroudakis, 2013). In the other study, results from the assay were consistent or compatible with clinicopathologic features in 84% of patients with reportable results.
2.3 DNA sequencing assays
One study reported results for indication of primary origin using DNA sequencing assays (Schipper, 2022). This study included 72 patients and was conducted in the Netherlands.
The proportion of patients with cancer of unknown primary origin with reportable results was not described in the paper. The CUPPA algorithm using whole genome sequencing identified a primary tumor type for 49 out of 72 patients (68%).
2.4 DNA methylation assays
One study reported results for indication of primary origin for DNA methylation assays (Moran, 2016). This study included 216 patients and was conducted in the USA, Spain, Germany, Italy, and Australia. The proportion of patients with reportable results was not described in the paper. The DNA methylation assay identified a primary tumor type for 188 out of 216 patients (87%).
2.5 Combination or comparison of different assays
One study reported results for indication of primary origin for a combination or comparison of different assays (Posner, 2023). This study included 215 patients and was conducted in Australia. The proportion of patients with reportable results was not described in the paper. RNA and DNA tests provided high confidence to medium confidence predictions for 80% of patients, and 94% of predictions were concordant with pathology (Posner, 2023).
One study reported results for indication of primary origin for four molecular testing methods (Möhrmann, 2022). This study included 70 patients and was conducted in Germany. All patients underwent transcriptome or methylome analysis, the proportion of reportable results for both tests was 79%. Transcriptome and methylome analysis provided evidence for the underlying entity in 62/70 (89%) patients. In 48 patients, classification was possible by both transcriptome and methylome analysis, however in only 20 patients the same entity was predicted by both methods.
Table 2. Overview of studies providing results on indication of origin for various comprehensive molecular analyses
* No failed analyses are reported in the paper, however it is not clear whether only successfully analyzed patients are included in the study
CUP: Cancer of unknown primary
FFPE: Formalin-Fixed Paraffin-Embedded
TOO: Tissue of Origin
Level of evidence of the literature
The level of evidence was not assessed since 15 out of 16 studies did not have a comparative design.
Zoeken en selecteren
A systematic review of the literature was performed to answer the following question:
What is the diagnostic yield, in terms of finding an indication for primary origin, of different comprehensive molecular analyses compared to no molecular analyses in patients with provisional CUP where the initial diagnostic work up has not led to the identification of the primary tumor?
| P: |
Patients with provisional PTO where the initial diagnostic work up has not led to the identification of the primary tumor |
| I: |
whole genome sequencing (WGS), or alternatively, other comprehensive molecular analyses (including methylation profiling, expression profiling and comprehensive NGS panels) |
| C: | No molecular analysis to identify primary origin |
| R: | Follow-up |
| O: | Indication for primary origin |
The definition of ‘initial diagnostic work up’ is provided in module Patiëntprofiel en diagnostische strategie of this guideline.
Relevant outcome measures
The guideline development group considered indication for primary origin as a critical outcome measure for decision making. A priori, the working group did not define the outcome measure listed above but used the definitions used in the studies.
Search and select (Methods)
The databases Medline (via OVID) and Embase (via Embase.com) were searched with relevant search terms until 9 January 2023. The detailed search strategy is depicted under the tab Methods. The systematic literature search resulted in 636 hits. Studies were selected based on the following criteria: (1) full text publication in English or Dutch, published since the previous search for the guideline in 2010; (2) population and intervention according to the PICO. 77 studies were initially selected based on title and abstract screening. After reading the full text, 60 studies were excluded (see the table with reasons for exclusion under the tab Methods). For question 1, the review by Rassy (2020) provided a table with an overview of comprehensive molecular analyses used to identify the tissue of origin. This table was used as a starting point to create an overview of comprehensive molecular analyses available. For question 2, 16 original studies provided relevant information about the diagnostic yield of comprehensive molecular analyses.
Referenties
- 1 - Ding Y, Jiang J, Xu J, Chen Y, Zheng Y, Jiang W, Mao C, Jiang H, Bao X, Shen Y, Li X, Teng L, Xu N. Site-specific therapy in cancers of unknown primary site: a systematic review and meta-analysis. ESMO Open. 2022 Apr;7(2):100407. doi: 10.1016/j.esmoop.2022.100407. Epub 2022 Mar 3. PMID: 35248824; PMCID: PMC8897579.
- 2 - Greco FA, Spigel DR, Yardley DA, Erlander MG, Ma XJ, Hainsworth JD. Molecular profiling in unknown primary cancer: accuracy of tissue of origin prediction. Oncologist. 2010;15(5):500-6. doi: 10.1634/theoncologist.2009-0328. Epub 2010 Apr 28. PMID: 20427384; PMCID: PMC3227979.
- 3 - Greco FA, Lennington WJ, Spigel DR, Hainsworth JD. Molecular profiling diagnosis in unknown primary cancer: accuracy and ability to complement standard pathology. J Natl Cancer Inst. 2013 Jun 5;105(11):782-90. doi: 10.1093/jnci/djt099. Epub 2013 May 2. PMID: 23641043.
- 4 - Greco FA, Lennington WJ, Spigel DR, Hainsworth JD. Poorly differentiated neoplasms of unknown primary site: diagnostic usefulness of a molecular cancer classifier assay. Mol Diagn Ther. 2015 Apr;19(2):91-7. doi: 10.1007/s40291-015-0133-8. PMID: 25758902.
- 5 - Hainsworth JD, Schnabel CA, Erlander MG, Haines DW 3rd, Greco FA. A retrospective study of treatment outcomes in patients with carcinoma of unknown primary site and a colorectal cancer molecular profile. Clin Colorectal Cancer. 2012 Jun;11(2):112-8. doi: 10.1016/j.clcc.2011.08.001. Epub 2011 Oct 14. PMID: 22000811.
- 6 - Hainsworth JD, Rubin MS, Spigel DR, Boccia RV, Raby S, Quinn R, Greco FA. Molecular gene expression profiling to predict the tissue of origin and direct site-specific therapy in patients with carcinoma of unknown primary site: a prospective trial of the Sarah Cannon research institute. J Clin Oncol. 2013 Jan 10;31(2):217-23. doi: 10.1200/JCO.2012.43.3755. Epub 2012 Oct 1. PMID: 23032625.
- 7 - Hayashi H, Kurata T, Takiguchi Y, Arai M, Takeda K, Akiyoshi K, Matsumoto K, Onoe T, Mukai H, Matsubara N, Minami H, Toyoda M, Onozawa Y, Ono A, Fujita Y, Sakai K, Koh Y, Takeuchi A, Ohashi Y, Nishio K, Nakagawa K. Randomized Phase II Trial Comparing Site-Specific Treatment Based on Gene Expression Profiling With Carboplatin and Paclitaxel for Patients With Cancer of Unknown Primary Site. J Clin Oncol. 2019 Mar.
- 8 - Krämer A, Bochtler T, Pauli C, Shiu KK, Cook N, de Menezes JJ, Pazo-Cid RA, Losa F, Robbrecht DG, Tomášek J, Arslan C, Özgüroğlu M, Stahl M, Bigot F, Kim SY, Naito Y, Italiano A, Chalabi N, Durán-Pacheco G, Michaud C, Scarato J, Thomas M, Ross JS, Moch H, Mileshkin L. Molecularly guided therapy versus chemotherapy after disease control in unfavourable cancer of unknown primary (CUPISCO): an open-label, randomised, phase 2 study. Lancet. 2024 Aug 10;404(10452):527-539. doi: 10.1016/S0140-6736(24)00814-6. Epub 2024 Jul 31. PMID: 39096924. 1;37(7):570-579. doi: 10.1200/JCO.18.00771. Epub 2019 Jan 17. PMID: 30653423.
- 9 - Losa F, Fernández I, Etxaniz O, Giménez A, Gomila P, Iglesias L, Longo F, Nogales E, Sánchez A, Soler G. SEOM-GECOD clinical guideline for unknown primary cancer (2021). Clin Transl Oncol. 2022 Apr;24(4):681-692. doi: 10.1007/s12094-022-02806-x. Epub 2022 Mar 23. PMID: 35320504; PMCID: PMC8986666.
- 10 - Möhrmann L, Werner M, Oleś M, Mock A, Uhrig S, Jahn A, Kreutzfeldt S, Fröhlich M, Hutter B, Paramasivam N, Richter D, Beck K, Winter U, Pfütze K, Heilig CE, Teleanu V, Lipka DB, Zapatka M, Hanf D, List C, Allgäuer M, Penzel R, Rüter G, Jelas I, Hamacher R, Falkenhorst J, Wagner S, Brandts CH, Boerries M, Illert AL, Metzeler KH, Westphalen CB, Desuki A, Kindler T, Folprecht G, Weichert W, Brors B, Stenzinger A, Schröck E, Hübschmann D, Horak P, Heining C, Fröhling S, Glimm H. Comprehensive genomic and epigenomic analysis in cancer of unknown primary guides molecularly-informed therapies despite heterogeneity. Nat Commun. 2022 Aug 2;13(1):4485. doi: 10.1038/s41467-022-31866-4. PMID: 35918329; PMCID: PMC9346116.
- 11 - Monzon FA, Medeiros F, Lyons-Weiler M, Henner WD. Identification of tissue of origin in carcinoma of unknown primary with a microarray-based gene expression test. Diagn Pathol. 2010 Jan 13;5:3. doi: 10.1186/1746-1596-5-3. PMID: 20205775; PMCID: PMC2823680.
- 12 - Moon I, LoPiccolo J, Baca SC, Sholl LM, Kehl KL, Hassett MJ, Liu D, Schrag D, Gusev A. Machine learning for genetics-based classification and treatment response prediction in cancer of unknown primary. Nat Med. 2023 Aug;29(8):2057-2067. doi: 10.1038/s41591-023-02482-6. Epub 2023 Aug 7. Erratum in: Nat Med. 2023 Nov 15;: PMID: 37550415.
- 13 - Moran S, Martínez-Cardús A, Sayols S, Musulén E, Balañá C, Estival-Gonzalez A, Moutinho C, Heyn H, Diaz-Lagares A, de Moura MC, Stella GM, Comoglio PM, Ruiz-Miró M, Matias-Guiu X, Pazo-Cid R, Antón A, Lopez-Lopez R, Soler G, Longo F, Guerra I, Fernandez S, Assenov Y, Plass C, Morales R, Carles J, Bowtell D, Mileshkin L, Sia D, Tothill R, Tabernero J, Llovet JM, Esteller M. Epigenetic profiling to classify cancer of unknown primary: a multicentre, retrospective analysis. Lancet Oncol. 2016 Oct;17(10):1386-1395. doi: 10.1016/S1470-2045(16)30297-2. Epub 2016 Aug 27. PMID: 27575023.
- 14 - Morawietz L, Floore A, Stork-Sloots L, Folprecht G, Buettner R, Rieger A, Dietel M, Huebner G. Comparison of histopathological and gene expression-based typing of cancer of unknown primary. Virchows Arch. 2010 Jan;456(1):23-9. doi: 10.1007/s00428-009-0867-y. Epub 2009 Dec 10. PMID: 20012089.
- 15 - National Comprehensive Cancer Network (NCCN) Clinical practice guideline. Occult Primary (Cancer of Unknown Primary [CUP]). Version 1.2022 – September 2, 2021. https://www.nccn.org/professionals/physician_gls/pdf/occult.pdf.
- 16 - National Institute for Health and Care Excellence (NICE). Clinical guideline [CG104]. Published 2010, last updated 2023. Metastatic malignant disease of of unknown primary origin in adults: diagnosis and management. https://www.nice.org.uk/guidance/cg104.
- 17 - Pentheroudakis G, Pavlidis N, Fountzilas G, Krikelis D, Goussia A, Stoyianni A, Sanden M, St Cyr B, Yerushalmi N, Benjamin H, Meiri E, Chajut A, Rosenwald S, Aharonov R, Spector Y. Novel microRNA-based assay demonstrates 92% agreement with diagnosis based on clinicopathologic and management data in a cohort of patients with carcinoma of unknown primary. Mol Cancer. 2013 Jun 10;12:57. doi: 10.1186/1476-4598-12-57. PMID: 23758919; PMCID: PMC3695805.
- 18 - Posner A, Prall OW, Sivakumaran T, Etemadamoghadam D, Thio N, Pattison A, Balachander S, Fisher K, Webb S, Wood C, DeFazio A, Wilcken N, Gao B, Karapetis CS, Singh M, Collins IM, Richardson G, Steer C, Warren M, Karanth N, Wright G, Williams S, George J, Hicks RJ, Boussioutas A, Gill AJ, Solomon BJ, Xu H, Fellowes A, Fox SB, Schofield P, Bowtell D, Mileshkin L, Tothill RW. A comparison of DNA sequencing and gene expression profiling to assist tissue of origin diagnosis in cancer of unknown primary. J Pathol. 2023 Jan;259(1):81-92. doi: 10.1002/path.6022. Epub 2022 Nov 30. PMID: 36287571; PMCID: PMC10099529.
- 19 - Van Putten J, Koster R, Snaebjornsson P, van Wezel T, Bosch LJW, Cuppen E, Monkhorst K. 1249P Whole genome sequencing-based cancer diagnostics in routine clinical practice: An interim analysis of two years of real-world data. Ann Oncol. 2023. 34(Supplement 2), S727.
- 20 - Rassy E, Pavlidis N. Progress in refining the clinical management of cancer of unknown primary in the molecular era. Nat Rev Clin Oncol. 2020 Sep;17(9):541-554. doi: 10.1038/s41571-020-0359-1. Epub 2020 Apr 29. PMID: 32350398.
- 21 - Schipper LJ, Samsom KG, Snaebjornsson P, Battaglia T, Bosch LJW, Lalezari F, Priestley P, Shale C, van den Broek AJ, Jacobs N, Roepman P, van der Hoeven JJM, Steeghs N, Vollebergh MA, Marchetti S, Cuppen E, Meijer GA, Voest EE, Monkhorst K. Complete genomic characterization in patients with cancer of unknown primary origin in routine diagnostics. ESMO Open. 2022 Dec;7(6):100611. doi: 10.1016/j.esmoop.2022.100611. Epub 2022 Dec 1. PMID: 36463731; PMCID: PMC9808446.
- 22 - Sunami K, Takahashi H, Tsuchihara K, Takeda M, Suzuki T, Naito Y, Sakai K, Dosaka-Akita H, Ishioka C, Kodera Y, Muto M, Wakai T, Yamazaki K, Yasui W, Bando H, Fujimoto Y, Fukuoka S, Harano K, Kawazoe A, Kimura G, Koganemaru S, Kogawa T, Kotani D, Kuboki Y, Matsumoto H, Matsumoto S, Mishima S, Nakamura Y, Sawada K, Shingaki S, Shitara K, Umemoto K, Umemura S, Yasuda K, Yoshino T, Yamamoto N, Nishio K; Japanese Society of Medical Oncology; Japan Society of Clinical Oncology; Japanese Cancer Association. Clinical practice guidance for next-generation sequencing in cancer diagnosis and treatment (Edition 1.0). Cancer Sci. 2018 Sep;109(9):2980-2985. doi: 10.1111/cas.13730. PMID: 30187675; PMCID: PMC6125473.
- 23 - Thomas SP, Jacobson LE, Victorio AR, Operaña TN, Schroeder BE, Schnabel CA, Braiteh F. Multi-Institutional, Prospective Clinical Utility Study Evaluating the Impact of the 92-Gene Assay (CancerTYPE ID) on Final Diagnosis and Treatment Planning in Patients With Metastatic Cancer With an Unknown or Unclear Diagnosis. JCO Precis Oncol. 2018 Nov;2:1-12. doi: 10.1200/PO.17.00145. PMID: 35135112.
- 24 - Qi P, Sun Y, Liu X, Wu S, Wo Y, Xu Q, Wang Q, Hu X, Zhou X. Clinicopathological, molecular and prognostic characteristics of cancer of unknown primary in China: An analysis of 1420 cases. Cancer Med. 2023 Jan;12(2):1177-1188. doi: 10.1002/cam4.4973. Epub 2022 Jul 13. PMID: 35822433; PMCID: PMC9883567.
- 25 - Varadhachary GR, Spector Y, Abbruzzese JL, Rosenwald S, Wang H, Aharonov R, Carlson HR, Cohen D, Karanth S, Macinskas J, Lenzi R, Chajut A, Edmonston TB, Raber MN. Prospective gene signature study using microRNA to identify the tissue of origin in patients with carcinoma of unknown primary. Clin Cancer Res. 2011 Jun 15;17(12):4063-70. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-10-2599. Epub 2011 Apr 29. PMID: 21531815.
- 26 - Vibert J, Pierron G, Benoist C, Gruel N, Guillemot D, Vincent-Salomon A, Le Tourneau C, Livartowski A, Mariani O, Baulande S, Bidard FC, Delattre O, Waterfall JJ, Watson S. Identification of Tissue of Origin and Guided Therapeutic Applications in Cancers of Unknown Primary Using Deep Learning and RNA Sequencing (TransCUPtomics). J Mol Diagn. 2021 Oct;23(10):1380-1392. doi: 10.1016/j.jmoldx.2021.07.009. Epub 2021 Jul 26. PMID: 34325056.
- 27 - Ye Q, Wang Q, Qi P, Chen J, Sun Y, Jin S, Ren W, Chen C, Liu M, Xu M, Ji G, Yang J, Nie L, Xu Q, Huang D, Du X, Zhou X. Development and Clinical Validation of a 90-Gene Expression Assay for Identifying Tumor Tissue Origin. J Mol Diagn. 2020 Sep;22(9):1139-1150. doi: 10.1016/j.jmoldx.2020.06.005. Epub 2020 Jun 28. Erratum in: J Mol Diagn. 2023 Feb;25(2):132. PMID: 32610162.
Evidence tabellen
Table of excluded studies
|
Reference |
Reason for exclusion |
|
Reviews |
|
|
Binder C, Matthes KL, Korol D, Rohrmann S, Moch H. Cancer of unknown primary-Epidemiological trends and relevance of comprehensive genomic profiling. Cancer Med. 2018 Sep;7(9):4814-4824. doi: 10.1002/cam4.1689. Epub 2018 Jul 17. PMID: 30019510; PMCID: PMC6144156. |
More recent review available (Rassy, 2020), more focused on treatment then origin |
|
Kato S, Alsafar A, Walavalkar V, Hainsworth J, Kurzrock R. Cancer of Unknown Primary in the Molecular Era. Trends Cancer. 2021 May;7(5):465-477. doi: 10.1016/j.trecan.2020.11.002. Epub 2021 Jan 28. PMID: 33516660; PMCID: PMC8062281. |
More comprehensive overview available (Rassy, 2020) |
|
Dermawan JK, Rubin BP. The role of molecular profiling in the diagnosis and management of metastatic undifferentiated cancer of unknown primary✰: Molecular profiling of metastatic cancer of unknown primary. Semin Diagn Pathol. 2021 Nov;38(6):193-198. doi: 10.1053/j.semdp.2020.12.001. Epub 2020 Dec 4. PMID: 33309276. |
More comprehensive overview available (Rassy, 2020) |
|
Hainsworth JD, Greco FA. Gene expression profiling in patients with carcinoma of unknown primary site: from translational research to standard of care. Virchows Arch. 2014 Apr;464(4):393-402. doi: 10.1007/s00428-014-1545-2. Epub 2014 Feb 1. PMID: 24487792. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Economopoulou P, Mountzios G, Pavlidis N, Pentheroudakis G. Cancer of Unknown Primary origin in the genomic era: Elucidating the dark box of cancer. Cancer Treat Rev. 2015 Jul;41(7):598-604. doi: 10.1016/j.ctrv.2015.05.010. Epub 2015 May 28. PMID: 26033502. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Massard C, Loriot Y, Fizazi K. Carcinomas of an unknown primary origin--diagnosis and treatment. Nat Rev Clin Oncol. 2011 Nov 1;8(12):701-10. doi: 10.1038/nrclinonc.2011.158. PMID: 22048624. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Meleth S, Whitehead N, Evans TS, Lux L. Technology Assessment on Genetic Testing or Molecular Pathology Testing of Cancers with Unknown Primary Site to Determine Origin [Internet]. Rockville (MD): Agency for Healthcare Research and Quality (US); 2013 Feb 20. PMID: 25855837. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Greco FA. Cancer of unknown primary site: evolving understanding and management of patients. Clin Adv Hematol Oncol. 2012 Aug;10(8):518-24. PMID: 23073050. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Greco FA, Oien K, Erlander M, Osborne R, Varadhachary G, Bridgewater J, Cohen D, Wasan H. Cancer of unknown primary: progress in the search for improved and rapid diagnosis leading toward superior patient outcomes. Ann Oncol. 2012 Feb;23(2):298-304. doi: 10.1093/annonc/mdr306. Epub 2011 Jun 27. PMID: 21709138. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Varadhachary GR. Carcinoma of unknown primary: focused evaluation. J Natl Compr Canc Netw. 2011 Dec;9(12):1406-12. doi: 10.6004/jnccn.2011.0119. PMID: 22157558. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Wittmann J, Jäck HM. Serum microRNAs as powerful cancer biomarkers. Biochim Biophys Acta. 2010 Dec;1806(2):200-7. doi: 10.1016/j.bbcan.2010.07.002. Epub 2010 Jul 13. PMID: 20637263. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Igbokwe A, Lopez-Terrada DH. Molecular testing of solid tumors. Arch Pathol Lab Med. 2011 Jan;135(1):67-82. doi: 10.5858/2010-0413-RAR.1. PMID: 21204713. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Monzon FA, Koen TJ. Diagnosis of metastatic neoplasms: molecular approaches for identification of tissue of origin. Arch Pathol Lab Med. 2010 Feb;134(2):216-24. doi: 10.5858/134.2.216. PMID: 20121609. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Greco FA. Cancer of unknown primary site: improved patient management with molecular and immunohistochemical diagnosis. Am Soc Clin Oncol Educ Book. 2013:175-81. doi: 10.14694/EdBook_AM.2013.33.175. PMID: 23714493. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Stella GM, Senetta R, Cassenti A, Ronco M, Cassoni P. Cancers of unknown primary origin: current perspectives and future therapeutic strategies. J Transl Med. 2012 Jan 24;10:12. doi: 10.1186/1479-5876-10-12. PMID: 22272606; PMCID: PMC3315427. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Monzon FA, Dumur CI. Diagnosis of uncertain primary tumors with the Pathwork tissue-of-origin test. Expert Rev Mol Diagn. 2010 Jan;10(1):17-25. doi: 10.1586/erm.09.75. PMID: 20014919. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Hendifar AE, Ramirez RA, Anthony LB, Liu E. Current Practices and Novel Techniques in the Diagnosis and Management of Neuroendocrine Tumors of Unknown Primary. Pancreas. 2019 Oct;48(9):1111-1118. doi: 10.1097/MPA.0000000000001391. PMID: 31609931; PMCID: PMC6830950. |
Narrative review on neuroendocrine tumours only |
|
Krawczyk P, Jassem J, Wojas-Krawczyk K, Krzakowski M, Dziadziuszko R, Olszewski W. New Genetic Technologies in Diagnosis and Treatment of Cancer of Unknown Primary. Cancers (Basel). 2022 Jul 14;14(14):3429. doi: 10.3390/cancers14143429. PMID: 35884492; PMCID: PMC9318615. |
More comprehensive overview available (Rassy, 2020) |
|
Dolled-Filhart MP, Rimm DL. Gene expression array analysis to determine tissue of origin of carcinoma of unknown primary: cutting edge or already obsolete? Cancer Cytopathol. 2013 Mar;121(3):129-35. doi: 10.1002/cncy.21228. Epub 2012 Aug 23. PMID: 22927160. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Berghoff AS, Bartsch R, Wöhrer A, Streubel B, Birner P, Kros JM, Brastianos PK, von Deimling A, Preusser M. Predictive molecular markers in metastases to the central nervous system: recent advances and future avenues. Acta Neuropathol. 2014 Dec;128(6):879-91. doi: 10.1007/s00401-014-1350-7. Epub 2014 Oct 7. PMID: 25287912. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Doxtader EE, Chute DJ. Evaluation of Carcinoma of Unknown Primary on Cytologic Specimens. Surg Pathol Clin. 2018 Sep;11(3):545-562. doi: 10.1016/j.path.2018.04.006. PMID: 30190140. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Lee MS, Sanoff HK. Cancer of unknown primary. BMJ. 2020 Dec 7;371:m4050. doi: 10.1136/bmj.m4050. PMID: 33288500. |
More comprehensive overview available (Rassy, 2020) |
|
Bochtler T, Löffler H, Krämer A. Diagnosis and management of metastatic neoplasms with unknown primary. Semin Diagn Pathol. 2018 May;35(3):199-206. doi: 10.1053/j.semdp.2017.11.013. Epub 2017 Nov 26. PMID: 29203116. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Bhatt A, Mishra S, Glehen O. Histopathological Evaluation and Molecular Diagnostic Tests for Peritoneal Metastases with Unknown Primary Site-a Review. Indian J Surg Oncol. 2023 Jun;14(Suppl 1):15-29. doi: 10.1007/s13193-022-01612-9. Epub 2022 Aug 4. PMID: 37359927; PMCID: PMC10284789. |
More comprehensive overview available (Rassy, 2020) |
|
Green AC. Cancer of unknown primary: does the key lie in molecular diagnostics? Cytopathology. 2015 Feb;26(1):61-3. doi: 10.1111/cyt.12235. PMID: 25683360. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Batistatou, A. and Pentheroudakis, G. and Pavlidis, N. Cancer of unknown primary site: The pathologist's point of view. Journal of OncoPathology. 2013. 1(1):47-54. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Stevenson M, Potti A. A pathway-based approach to identify molecular biomarkers in cancer. Ann Surg Oncol. 2012 Jul;19 Suppl 3:S620-4. doi: 10.1245/s10434-011-1855-4. Epub 2011 Nov 3. PMID: 22048630. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Rassy E, Pavlidis N. The diagnostic challenges of patients with carcinoma of unknown primary. Expert Rev Anticancer Ther. 2020 Sep;20(9):775-783. doi: 10.1080/14737140.2020.1807948. Epub 2020 Sep 2. PMID: 32779501. |
More comprehensive overview available (Rassy, 2020) |
|
Natoli C, Ramazzotti V, Nappi O, Giacomini P, Palmeri S, Salvatore M, Landriscina M, Zilli M, Natali PG, Tinari N, Iacobelli S. Unknown primary tumors. Biochim Biophys Acta. 2011 Aug;1816(1):13-24. doi: 10.1016/j.bbcan.2011.02.002. Epub 2011 Mar 1. PMID: 21371531. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Takei H, Monzon FA. Gene-expression assays and personalized cancer care: tissue-of-origin test for cancer of unknown primary origin. Per Med. 2011 Jul;8(4):429-436. doi: 10.2217/pme.11.37. PMID: 29783334. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Pavlidis N, Pentheroudakis G. Cancer of unknown primary site. Lancet. 2012 Apr 14;379(9824):1428-35. doi: 10.1016/S0140-6736(11)61178-1. Epub 2012 Mar 12. PMID: 22414598. |
More recent review available (Rassy, 2020) |
|
Original studies |
|
|
Vikeså J, Møller AK, Kaczkowski B, Borup R, Winther O, Henao R, Krogh A, Perell K, Jensen F, Daugaard G, Nielsen FC. Cancers of unknown primary origin (CUP) are characterized by chromosomal instability (CIN) compared to metastasis of know origin. BMC Cancer. 2015 Mar 19;15:151. doi: 10.1186/s12885-015-1128-x. PMID: 25885340; PMCID: PMC4404593.
|
Wrong outcome (comparison with metastases of known origin)
|
|
Saeed OAM, Armutlu A, Cheng L, Longe HO, Saxena R. Tumor Genomic Profiling to Determine Tissue Origin of Cancers of Unknown Primary: A Single Institute Experience With its Utility and Impact on Patient Management. Appl Immunohistochem Mol Morphol. 2022 Oct 1;30(9):592-599. doi: 10.1097/PAI.0000000000001057. Epub 2022 Sep 6. PMID: 36083154.
|
Intervention not clearly described |
|
Kim M, Jeong JY, Park NJ, Park JY. Clinical Utility of Next-generation Sequencing in Real-world Cases: A Single-institution Study of Nine Cases. In Vivo. 2022 May-Jun;36(3):1397-1407. doi: 10.21873/invivo.12844. PMID: 35478134; PMCID: PMC9087115.
|
Population not clearly described |
|
Kang, S., Jeong, J.H., Yoon, S. et al. Real-world data analysis of patients with cancer of unknown primary. Sci Rep 11, 23074 (2021). https://doi.org/10.1038/s41598-021-02543-1
|
No relevant outcomes, focus on treatment |
|
Lawrence L, Kunder CA, Fung E, Stehr H, Zehnder J. Performance Characteristics of Mutational Signature Analysis in Targeted Panel Sequencing. Arch Pathol Lab Med. 2021 Nov 1;145(11):1424-1431. doi: 10.5858/arpa.2020-0536-OA. PMID: 33571361.
|
Wrong intervention (no real CUP classifier)
|
|
Bochtler T, Wohlfromm T, Hielscher T, Stichel D, Pouyiourou M, Kraft B, Neumann O, Endris V, von Deimling A, Stenzinger A, Krämer A. Prognostic impact of copy number alterations and tumor mutational burden in carcinoma of unknown primary. Genes Chromosomes Cancer. 2022 Sep;61(9):551-560. doi: 10.1002/gcc.23047. Epub 2022 Apr 30. PMID: 35430765.
|
No relevant outcomes, focus on treatment |
|
Bochtler T, Endris V, Leichsenring J, Reiling A, Neumann O, Volckmar AL, Kirchner M, Allgäuer M, Schirmacher P, Krämer A, Stenzinger A. Comparative genetic profiling aids diagnosis and clinical decision making in challenging cases of CUP syndrome. Int J Cancer. 2019 Dec 1;145(11):2963-2973. doi: 10.1002/ijc.32316. Epub 2019 Apr 29. PMID: 30963573.
|
No relevant outcomes. Focus on CUP patients with documented prior malignancies. |
|
Gatalica Z, Xiu J, Swensen J, Vranic S. Comprehensive analysis of cancers of unknown primary for the biomarkers of response to immune checkpoint blockade therapy. Eur J Cancer. 2018 May;94:179-186. doi: 10.1016/j.ejca.2018.02.021. Epub 2018 Mar 20. PMID: 29571084.
|
No relevant outcomes, focus on treatment |
|
Bae JM, Ahn JY, Lee H, Jang H, Han H, Jeong J, Cho NY, Kim K, Kang GH. Identification of tissue of origin in cancer of unknown primary using a targeted bisulfite sequencing panel. Epigenomics. 2022 May;14(10):615-628. doi: 10.2217/epi-2021-0477. Epub 2022 Apr 27. PMID: 35473295.
|
Wrong population (no CUP cohort, only tumours with known origin) |
|
Stella GM, Benvenuti S, Gramaglia D, Scarpa A, Tomezzoli A, Cassoni P, Senetta R, Venesio T, Pozzi E, Bardelli A, Comoglio PM. MET mutations in cancers of unknown primary origin (CUPs). Hum Mutat. 2011 Jan;32(1):44-50. doi: 10.1002/humu.21374. Epub 2010 Nov 9. PMID: 20949619.
|
Wrong intervention (no CUP classifier, only MET mutations)
|
|
Grenert JP, Smith A, Ruan W, Pillai R, Wu AH. Gene expression profiling from formalin-fixed, paraffin-embedded tissue for tumor diagnosis. Clin Chim Acta. 2011 Jul 15;412(15-16):1462-4. doi: 10.1016/j.cca.2011.04.001. Epub 2011 Apr 7. PMID: 21497155.
|
Wrong population (no CUP cohort, only tumours with known origin) |
|
Azueta A, Maiques O, Velasco A, Santacana M, Pallares J, Novell A, Llombart-Cussac A, Gonzalez-Tallada X, Mozos A, Prat J, Pillai R, Mata M, Matias-Guiu X. Gene expression microarray-based assay to determine tumor site of origin in a series of metastatic tumors to the ovary and peritoneal carcinomatosis of suspected gynecologic origin. Hum Pathol. 2013 Jan;44(1):20-8. doi: 10.1016/j.humpath.2012.04.018. Epub 2012 Aug 30. PMID: 22939961.
|
Wrong population (limited to 7 gynecological tumours, no IHC performed yet)
|
|
Dumur CI, Fuller CE, Blevins TL, Schaum JC, Wilkinson DS, Garrett CT, Powers CN. Clinical verification of the performance of the pathwork tissue of origin test: utility and limitations. Am J Clin Pathol. 2011 Dec;136(6):924-33. doi: 10.1309/AJCPDQPFO73SSNFR. PMID: 22095379.
|
Wrong study design (only 7 patients with CUP)
|
|
Laprovitera N, Riefolo M, Porcellini E, Durante G, Garajova I, Vasuri F, Aigelsreiter A, Dandachi N, Benvenuto G, Agostinis F, Sabbioni S, Berindan Neagoe I, Romualdi C, Ardizzoni A, Trerè D, Pichler M, D'Errico A, Ferracin M. MicroRNA expression profiling with a droplet digital PCR assay enables molecular diagnosis and prognosis of cancers of unknown primary. Mol Oncol. 2021 Oct;15(10):2732-2751. doi: 10.1002/1878-0261.13026. Epub 2021 Jun 23. PMID: 34075699; PMCID: PMC8486570.
|
Population not clearly described
|
|
Meiri E, Mueller WC, Rosenwald S, Zepeniuk M, Klinke E, Edmonston TB, Werner M, Lass U, Barshack I, Feinmesser M, Huszar M, Fogt F, Ashkenazi K, Sanden M, Goren E, Dromi N, Zion O, Burnstein I, Chajut A, Spector Y, Aharonov R. A second-generation microRNA-based assay for diagnosing tumor tissue origin. Oncologist. 2012;17(6):801-12. doi: 10.1634/theoncologist.2011-0466. Epub 2012 May 22. PMID: 22618571; PMCID: PMC3380879.
|
Population not clearly described |
|
Ferracin M, Pedriali M, Veronese A, Zagatti B, Gafà R, Magri E, Lunardi M, Munerato G, Querzoli G, Maestri I, Ulazzi L, Nenci I, Croce CM, Lanza G, Querzoli P, Negrini M. MicroRNA profiling for the identification of cancers with unknown primary tissue-of-origin. J Pathol. 2011 Sep;225(1):43-53. doi: 10.1002/path.2915. Epub 2011 Jun 1. PMID: 21630269; PMCID: PMC4325368.
|
Population not clearly described
|
|
Mueller WC, Spector Y, Edmonston TB, St Cyr B, Jaeger D, Lass U, Aharonov R, Rosenwald S, Chajut A. Accurate classification of metastatic brain tumors using a novel microRNA-based test. Oncologist. 2011;16(2):165-74. doi: 10.1634/theoncologist.2010-0305. Epub 2011 Jan 27. PMID: 21273512; PMCID: PMC3228095.
|
Population not clearly described |
|
Chen K, Zhang F, Yu X, Huang Z, Gong L, Xu Y, Li H, Yu S, Fan Y. A molecular approach integrating genomic and DNA methylation profiling for tissue of origin identification in lung-specific cancer of unknown primary. J Transl Med. 2022 Apr 5;20(1):158. doi: 10.1186/s12967-022-03362-2. PMID: 35382836; PMCID: PMC8981640.
|
Wrong population (lung-specific CUP) and wrong study design (n=16)
|
|
Fusco MJ, Knepper TC, Balliu J, Del Cueto A, Laborde JM, Hooda SM, Brohl AS, Bui MM, Hicks JK. Evaluation of Targeted Next-Generation Sequencing for the Management of Patients Diagnosed with a Cancer of Unknown Primary. Oncologist. 2022 Feb 3;27(1):e9-e17. doi: 10.1093/oncolo/oyab014. PMID: 35305098; PMCID: PMC8842368.
|
Population not clearly described |
|
Abraham J, Heimberger AB, Marshall J, Heath E, Drabick J, Helmstetter A, Xiu J, Magee D, Stafford P, Nabhan C, Antani S, Johnston C, Oberley M, Korn WM, Spetzler D. Machine learning analysis using 77,044 genomic and transcriptomic profiles to accurately predict tumor type. Transl Oncol. 2021 Mar;14(3):101016. doi: 10.1016/j.tranon.2021.101016. Epub 2021 Jan 16. PMID: 33465745; PMCID: PMC7815805.
|
Population not clearly described |
|
Cobain EF, Wu YM, Vats P, Chugh R, Worden F, Smith DC, Schuetze SM, Zalupski MM, Sahai V, Alva A, Schott AF, Caram MEV, Hayes DF, Stoffel EM, Jacobs MF, Kumar-Sinha C, Cao X, Wang R, Lucas D, Ning Y, Rabban E, Bell J, Camelo-Piragua S, Udager AM, Cieslik M, Lonigro RJ, Kunju LP, Robinson DR, Talpaz M, Chinnaiyan AM. Assessment of Clinical Benefit of Integrative Genomic Profiling in Advanced Solid Tumors. JAMA Oncol. 2021 Apr 1;7(4):525-533. doi: 10.1001/jamaoncol.2020.7987. PMID: 33630025; PMCID: PMC7907987.
|
Population not clearly described |
|
Posner A, Prall OWJ, Sivakumaran T, Etemadamoghadam D, Thio N, Pattison A, Balachander S, Fisher K, Webb S, Wood C, DeFazio A, Wilcken N, Gao B, Karapetis CS, Singh M, Collins IM, Richardson G, Steer C, Warren M, Karanth N, Wright G, Williams S, George J, Hicks RJ, Boussioutas A, Gill AJ, Solomon BJ, Xu H, Fellowes A, Fox SB, Schofield P, Bowtell D, Mileshkin L, Tothill RW. DNA sequencing and gene-expression profiling assists in making a tissue of origin diagnosis in cancer of unknown primary. Preprint. doi: https://doi.org/10.1101/2022.06.24.22276729 |
Duplicate, pre-print of Posner (2023) |
|
Tothill RW, Shi F, Paiman L, Bedo J, Kowalczyk A, Mileshkin L, Buela E, Klupacs R, Bowtell D, Byron K. Development and validation of a gene expression tumour classifier for cancer of unknown primary. Pathology. 2015 Jan;47(1):7-12. doi: 10.1097/PAT.0000000000000194. PMID: 25485653. |
Population not clearly described |
|
Moiso E, Farahani A, Marble HD, Hendricks A, Mildrum S, Levine S, Lennerz JK, Garg S. Developmental Deconvolution for Classification of Cancer Origin. Cancer Discov. 2022 Nov 2;12(11):2566-2585. doi: 10.1158/2159-8290.CD-21-1443. PMID: 36041084; PMCID: PMC9627133. |
Wrong population |
|
Tessier-Cloutier B, Grewal JK, Jones MR, Pleasance E, Shen Y, Cai E, Dunham C, Hoang L, Horst B, Huntsman DG, Ionescu D, Karnezis AN, Lee AF, Lee CH, Lee TH, Twa DD, Mungall AJ, Mungall K, Naso JR, Ng T, Schaeffer DF, Sheffield BS, Skinnider B, Smith T, Williamson L, Zhong E, Regier DA, Laskin J, Marra MA, Gilks CB, Jones SJ, Yip S. The impact of whole genome and transcriptome analysis (WGTA) on predictive biomarker discovery and diagnostic accuracy of advanced malignancies. J Pathol Clin Res. 2022 Jul;8(4):395-407. doi: 10.1002/cjp2.265. Epub 2022 Mar 8. PMID: 35257510; PMCID: PMC9161328. |
Wrong population |
|
Tothill RW, Li J, Mileshkin L, Doig K, Siganakis T, Cowin P, Fellowes A, Semple T, Fox S, Byron K, Kowalczyk A, Thomas D, Schofield P, Bowtell DD. Massively-parallel sequencing assists the diagnosis and guided treatment of cancers of unknown primary. J Pathol. 2013 Dec;231(4):413-23. doi: 10.1002/path.4251. PMID: 24037760. |
Wrong population (purposive selection of a spectrum of common CUP clinical presentations), small sample (n=16) |
|
Laouri M, Halks-Miller M, Henner WD, Nystrom JS. Potential clinical utility of gene-expression profiling in identifying tumors of uncertain origin. Per Med. 2011 Nov;8(6):615-622. doi: 10.2217/pme.11.65. PMID: 29776206. |
Population not clearly described |
|
Zhang Y, Xia L, Ma D, Wu J, Xu X, Xu Y. 90-Gene Expression Profiling for Tissue Origin Diagnosis of Cancer of Unknown Primary. Front Oncol. 2021 Oct 7;11:722808. doi: 10.3389/fonc.2021.722808. PMID: 34692498; PMCID: PMC8529103. |
Population not clearly described |
|
Chauhan A, Farooqui Z, Silva SR, Murray A, Hodges KB, Yu Q, Myint ZW, Raajesekar AK, Weiss H, Arnold S, Evers BM, Anthony L. Integrating a 92-Gene Expression Analysis for the Management of Neuroendocrine Tumors of Unknown Primary. Asian Pac J Cancer Prev. 2019 Jan 25;20(1):113-116. doi: 10.31557/APJCP.2019.20.1.113. PMID: 30678389; PMCID: PMC6485590.
|
Population not clearly described, only neuroendocrine tumors of unknown primary
|
Verantwoording
Beoordelingsdatum en geldigheid
Laatst beoordeeld : 08-10-2025
Algemene gegevens
De ontwikkeling/herziening van deze richtlijnmodule werd ondersteund door het Kennisinstituut van de Federatie Medisch Specialisten (www.demedischspecialist.nl/kennisinstituut) en werd gefinancierd uit de Stichting Kwaliteitsgelden Medisch Specialisten (SKMS).
De financier heeft geen enkele invloed gehad op de inhoud van de richtlijnmodule.
Samenstelling werkgroep
Voor het ontwikkelen van de richtlijnmodule is in 2021 een multidisciplinaire werkgroep ingesteld, bestaande uit vertegenwoordigers van alle relevante specialismen (zie hiervoor de Samenstelling van de werkgroep) die betrokken zijn bij de zorg voor patiënten met een primaire tumor onbekend.
Werkgroep
- prof. dr. P. (Petur) Snaebjornsson (voorzitter), Patholoog, Antoni van Leeuwenhoek, Amsterdam, NVVP
- dr. M.L. (Marc) Ooft, Patholoog, Rijnstate, Arnhem, NVVP
- dr. L.I. (Leonie) Kroeze, Klinisch moleculair bioloog, Radboud UMC, Nijmegen, NVVP
- dr. D.G.J. (Debbie) Robbrecht, Internist, Erasmus MC, Rotterdam, NIV/NVMO
- dr. A.J. (Yes) van de Wouw, Internist, VieCuri Medisch Centrum, Venlo, NIV/NVMO
- dr. M.A. (Marieke) Vollebergh, Internist, Antoni van Leeuwenhoek, Amsterdam, NIV/NVMO
- prof. dr. A.J. (Anthonie) van der Wekken, Longarts, UMCG, Groningen, NVALT
- dr. A.M.J. (Anke) Kuijpers, Chirurg, Antoni van Leeuwenhoek, Amsterdam, NVvH
- dr. Q. (Quirijn) Tummers, Chirurg, Antoni van Leeuwenhoek, Amsterdam, NVvH
- dr. M. (Martin) Lacko, KNO-arts/ Hoofd-hals chirurg, MUMC, Maastricht, NVKNO
- dr. J. (Jessie) Westerhof, MDL-arts, UMCG, Groningen, NVMDL
- dr. M.C. (Maartje) van Rijk, Nucleair geneeskundige, Radboud UMC, Nijmegen, NVNG
- W.A. (Warnyta) Minnaard, Patiëntenvertegenwoordiger, Missie Tumor Onbekend
- F.C.M. (Francine) van der Heijden, Patiëntenvertegenwoordiger, Missie Tumor Onbekend
- prof. dr. C.H.J. (Chris) Terhaard, Radiotherapeut-oncoloog, UMCU, Utrecht, NVRO
- dr. D.M.H.J. (Deirdre) Hekkelman-ten Berge, Radioloog, ADRZ, Goes, NVvR
- dr. A. (Alexander) de Graeff, Internist-oncoloog/hospice-arts, UMCU, Utrecht, Palliactief
- C. (Christien) de Jong, GZ-psycholoog/psychotherapeut, Amsterdams Instituut voor Gezins- en Relatietherapie, Amsterdam, NVPO
- D. (Daphne) Rethmeier, oncologieverpleegkundige, Radboud UMC, Nijmegen, V&VN
- D. (Diane) van Biessen, verpleegkundig specialist, Erasmus MC, Rotterdam, V&VN
- dr. C. (Caroline) Loef, adviseur, Integraal Kankercentrum Nederland, Utrecht
Klankbordgroep
- dr. E. (Esther) van Meerten, internist-oncoloog, Erasmus MC, Rotterdam, NIV
Met ondersteuning van
- dr. C.M.W. (Charlotte) Gaasterland, Adviseur, Kennisinstituut van de Federatie Medisch Specialisten
- drs. I. (Isabelle) Laseur, Adviseur, Kennisinstituut van de Federatie Medisch Specialisten
- dr. M. (Merel) Wassenaar, Adviseur, Kennisinstituut van de Federatie Medisch Specialisten
- dr. L. (Linda) Oostendorp, Senior Adviseur, Kennisinstituut van de Federatie Medisch Specialisten
- dr. J. (Jana) Tuijtelaars, Adviseur, Kennisinstituut van de Federatie Medisch Specialisten
- D.P. (Diana) Gutierrez, projectmedewerker, Kennisinstituut van de Federatie Medisch Specialisten
- dr. J. (Jing) de Haan-Du, Adviseur, Kennisinstituut van de Federatie Medisch Specialisten
Belangenverklaringen
De Code ter voorkoming van oneigenlijke beïnvloeding door belangenverstrengeling is gevolgd. Alle werkgroepleden hebben schriftelijk verklaard of zij in de laatste drie jaar directe financiële belangen (betrekking bij een commercieel bedrijf, persoonlijke financiële belangen, onderzoeksfinanciering) of indirecte belangen (persoonlijke relaties, reputatiemanagement) hebben gehad. Gedurende de ontwikkeling of herziening van een module worden wijzigingen in belangen aan de voorzitter doorgegeven. De belangenverklaring wordt opnieuw bevestigd tijdens de commentaarfase.
Een overzicht van de belangen van werkgroepleden en het oordeel over het omgaan met eventuele belangen vindt u in onderstaande tabel. De ondertekende belangenverklaringen zijn op te vragen bij het secretariaat van het Kennisinstituut van de Federatie Medisch Specialisten.
|
Naam |
Hoofdfunctie |
Nevenwerkzaamheden |
Persoonlijke Financiële Belangen |
Persoonlijke Relaties |
Extern gefinancierd onderzoek |
Intell. belangen en reputatie |
Overige belangen |
Datum |
|
Alexander de Graeff |
Arts Academisch Hospice Demeter, De Bilt |
Adviseur richtlijnen IKNL |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
14-07-2022 |
|
Anke Kuijpers |
Chirurg, Antoni van Leeuwenhoek |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
24-11-2023 |
|
Anthonie van der Wekken |
Longarts |
geen |
geen |
geen |
Astra Zeneca, Boehringer-Ingelheim, Pfizer, Roche, Takeda |
Specialisten panel Patiënten vereniging 'Longkanker Nederland' |
Adviesraden of lezingen gegeven gesponsord door bedrijven voor het UMCG: Agena, Astra-Zeneca, Bayer, BMS, Boehringer-Ingelheim, Janssen, MSD, Pfizer, Roche, Takeda |
23-05-2022 |
|
Anthonie van der Wekken (aanvulling in 2024) |
Longarts |
geen |
geen |
geen |
Astra Zeneca, Boehringer-Ingelheim, Pfizer, Roche, Takeda |
Specialisten panel Patiëntenvereniging 'Longkanker Nederland'. Daarnaast specialist panel ‘ROS1ders’ en adviseur NFU en FMS. |
Deelgenomen aan adviesraden of lezingen gegeven gesponsord door bedrijven voor het UMCG: Agena, Astra-Zeneca, Bayer, BMS, Boehringer-Ingelheim, Janssen, MSD, Pfizer, Roche, Takeda en Lilly. |
6-03-2024 |
|
Caroline Loef (heeft de werkgroep in juli 2023 verlaten ivm een wisseling van baan) |
IKNL - Onderzoeker/Adviseur - betaald |
Kanker.nl - moderator - onbetaald |
Geen |
nee |
nee |
geen belang |
geen belang |
24-05-2022 |
|
Caroline Loef (aanvulling belangen in augustus 2022) |
IKNL - Onderzoeker/Adviseur - betaald |
Lid raad van Advies - Missie Tumor onbekend |
geen, alle nevenfuncties zijn ook op vrijwillige basis |
geen |
geen |
Uiteraard geeft dit voor alle deelnemers aan de richtlijnrevisie een zekere erkenning dan wel reputatie/positie of versterking daarvan in het werkveld. Dus dat geldt ook voor mijn persoon, tenminste wanneer de namen vermeldt worden. Zo niet, dan zal er geen belang zijn. |
geen |
4-08-2022 |
|
Chris Terhaard |
Radiotherapeut-oncoloog, emeritus |
Voor ELEKTA beoordeling AI van OAR hoofd-hals |
Geen financieel voordeel |
Geen |
Geen deelname onderzoek |
Geen |
Geen |
9-11-2022 |
|
Debbie Robbrecht |
Medisch specialist (internist-oncoloog) |
geen |
Nee |
Nee |
Nee |
Nee |
Hoofdonderzoeker van een landelijk ontwikkeld protocol voor dataverzameling rond patiënten met PTO. Dit kent tot nog toe geen financiering. Het doel is om van patiënten met PTO de gegevens te verzamelen ten aanzien van kliniek en eventueel WGS (DNA test), als ook kwaliteit van leven vragenlijsten. |
13-05-2022 |
|
Deirdre Hekkelman-ten Berge |
Radioloog, ADRZ, betaald |
Arts onderzoeker longgeneeskunde, onbetaald |
geen belangenverstrengelingen |
Geen |
Geen |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
13-07-2022 |
|
Diane van der Biessen (heeft de werkgroep in januari 2024 verlaten) |
Verpleegkundig specialist, Center for Drug Development, Erasmus MC Kanker Instituut. Werkzaamheden: Standaard medische zorg en verpleegkundige zorg bij patiënten met vergevorderde kanker die deelnemen aan vroeg klinisch onderzoek. Betaald |
Betaald: |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
9-08-2022 |
|
Francine van der Heijden |
Zangeres/zangdocent Bestuurder, oprichter en vrijwilliger bij Missie Tumor Onbekend |
Vertegenwoordiger patiëntenorganisatie Missie Tumor Onbekend |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
opdrachtgever, zonder financieel belang, van de e-learning Palliatieve zorg voor kankerpatiënten met een korte levensverwachting |
Niet van toepassing |
30-05-2022 |
|
Houke Klomp (heeft de werkgroep eind 2023 verlaten) |
chirurg Antoni van Leeuwenhoek (NKI-AVL) |
lid raad van commissarissen Prinses Maxima Centrum |
patent WO2010116003 A2, PCT/EP2010/054772, dit is ongerelateerd aan de richtlijn PTO |
- |
ja |
- |
- |
8-07-2022 |
|
Jessie Westerhof |
MDL-arts |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing. |
Niet van toepassing |
23-05-2022 |
|
Leonie Kroeze |
Klinisch moleculair bioloog in de pathologie (KMBP) - Radboudumc Nijmegen. Verantwoordelijk voor moleculaire diagnostiek op weefsels, met name van tumoren (betaald) |
Geen |
Geen |
Geen persoonlijke relaties |
Betrokken bij een KWF project als Principal Investigator. (Dit project heeft geen raakvlakken met deze richtlijncommissie) |
Geen |
Geen |
31-05-2022 |
|
Leonie Kroeze (aanvulling in juli 2022) |
Klinisch moleculair bioloog in de pathologie - Radboudumc Nijmegen |
Geen |
Geen |
Geen |
Ik heb zelf geen financiering binnengehaald afgelopen 3 jaar. Uiteraard ben ik zo af en toe wel betrokken bij projecten waarvoor externe financiering beschikbaar is (als onze afdeling gevraagd wordt de NGS analyses uit te voeren), echter sta ik niet als persoon genoemd op deze beursaanvragen. |
Geen |
Ik ben betrokken bij het opzetten van de zorgpad voor PTO-patiënten binnen het Radboudumc. |
22-07-2022 |
|
Maartje van Rijk |
Nucleair Geneeskundige/Nucleair Radioloog te RadboudUMC |
lid CKB NVNG (Commissie Kwaliteits Bewaking NVNG), onbetaald |
Pfizer aandelen (update 29-06-2022: heeft geen aandelen Pfizer meer) |
Nee |
Nee |
Nee |
Nee |
28-04-2022 |
|
Marc Ooft |
Patholoog |
patholoog werkzaam in pathologie DNA locatie Rijnstate |
Niet van belang |
Ik werk in hetzelfde ziekenhuis met een oncoloog welke de DI CUP richtlijn geschreven heeft |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
15-06-2022 |
|
Marieke Vollebergh |
internist-oncoloog |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
Hoofdonderzoeker van een landelijk ontwikkeld protocol voor dataverzameling rond patiënten met PTO. Dit kent tot nog toe geen financiering. Het doel is om van patiënten met PTO de gegevens te verzamelen ten aanzien van kliniek en eventueel WGS (DNA test), als ook kwaliteit van leven vragenlijsten. |
16-05-2022 |
|
Martin Lacko |
KNO-arts/hoofd-hals chirurg |
geen |
Geen |
Nee |
Nee |
Geen |
Geen |
24-08-2022 |
|
Petur Snaebjornsson (voorzitter) |
Patholoog in Antoni van Leeuwenhoek. Professor aan Universiteit van IJsland. |
1) Bestuur Dutch Colorectal Cancer Group (DCCG) sinds 2018 (onbetaald). |
1) Op 1 oktober 2020: online Expert Input Forum, georganiseerd door MSD. Onderwerp: MSI-H colorectaalcarcinoom. Hiervoor betaling aan AVL. |
Geen. |
Ik ben betrokken bij onderzoek i.h.k.v. colorectaalcarcinoom gefinancieerd door KWF (CAIRO6, COLOPEC 1 en 2). |
Geen. |
Geen. |
5-05-2022 |
|
Petur Snaebjornsson (voorzitter) (aanvulling in 2024) |
Patholoog in Antoni van Leeuwenhoek. Professor aan Universiteit van IJsland. |
1) Bestuur Dutch Colorectal Cancer Group (DCCG) van 2018 tot oktober 2022 (onbetaald). |
1) Op 1 oktober 2020: online Expert Input Forum, georganiseerd door MSD. Onderwerp: MSI-H colorectaalcarcinoom. Hiervoor betaling aan AVL. |
Geen. |
Ik ben betrokken bij onderzoek i.h.k.v. colorectaalcarcinoom gefinancieerd door KWF (CAIRO6, COLOPEC 1 en 2). |
Geen. |
Aanvulling 2024: Ik ben een hoofdonderzoeker van een project waarbij de doel is om de WGS predictie tool van HMF (CUPPA) te verbeteren. De hypothese is dat met verfijning van de tumorclassificatie in het referentiedataset van de CUPPA tool het mogelijk wordt om tumoren van onbekende origine beter te classificeren. Het is dus de bedoeling om alle casustiek in AVL en zo mogelijk in externe zkh, waar WGS bij HMF is verricht, te doornemen en de registratie van tumortype/origine op orde te brengen. Dit project kent tot nu toe geen financiering. Ik ben ook betrokken als mede-onderzoeker van het genomische landscape van PTO (dit onderzoek wordt in EMC verricht). |
5-03-2024 |
|
Quirijn Tummers (vervanger van Anke Kuijpers tijdens haar zwangerschapsverlof) |
Chirurg Antoni van Leeuwenhoek - Nederlands Kanker Instituut |
Geen |
Geen |
Geen |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
13-06-2024 |
|
Warnyta Minnaard |
Investment manager bij Noaber Ventures (betaalde baan in venture capital met focus op digital health/preventie) |
Bestuurder, oprichter en vrijwilliger bij Missie Tumor Onbekend (patiëntenorganisatie) |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
8-05-2022 |
|
Warnyta Minnaard (aanvulling in maart 2024) |
Project manager bij het Nederlands Kanker Collectief op de uitgelichte doelen zeldzame kanker en rookpreventie van de Nederlandse Kanker Agenda (parttime betaalde baan) |
- Bestuurder, oprichter en vrijwilliger bij Missie Tumor Onbekend - Onbezoldigd lid bestuurd CUPP-NL |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
Niet van toepassing |
- Lid van de Data Access Board van Hartwig Medical Foundation (op persoonlijke titel) |
5-03-2024 |
|
Yes van de Wouw |
Internist-oncoloog in Viecuri Medisch Centrum Noord-Limburg. |
Onbezoldigd lid bestuur CUPPNL |
Geen |
Geen |
Geen |
Nvt |
Nvt |
14-10-2023 |
|
Yes van de Wouw (aanvulling in maart 2024) |
Gepensioneerd Internist-oncoloog in Viecuri Medisch Centrum Noord-Limburg. |
Onbezoldigd lid bestuur CUPPNL |
Geen |
Geen |
Geen |
Nvt |
Nvt |
5-03-2024 |
|
Daphne Rethmeier |
Oncologieverpleegkundige/ casemanager |
Als geschoold oncologieverpleegkundige begeleid ik in mijn rol als casemanager patiënten met borstkanker of een primaire tumor onbekend tijdens hun behandeltraject (24 uur per week, betaald). ik fungeer als hun eerste aanspreekpunt voor hun vragen en zorgen. Ik houd zicht op hun behandelproces en onderhoud contact met alle betrokken zorgverleners. Als oncologieverpleegkundige ben ik ook 8 uur per 2 weken een dag werkzaam op ons callcenter (betaald) voor uitvoer van triage. |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
Geen |
9-1-2025 |
Inbreng patiëntenperspectief
Er werd aandacht besteed aan het patiëntenperspectief door deelname van de afgevaardigde patiëntenorganisatie Missie Tumor Onbekend in de werkgroep. De afgevaardigde heeft meebeslist bij het opstellen van de uitgangsvragen, de keuze voor de uitkomstmaten en bij het opstellen van de overwegingen. De conceptrichtlijn is tevens voor commentaar voorgelegd aan Missie Tumor Onbekend en de eventueel aangeleverde commentaren zijn bekeken en verwerkt.
Wkkgz & Kwalitatieve raming van mogelijke substantiële financiële gevolgen
Bij de richtlijn is conform de Wet kwaliteit, klachten en geschillen zorg (Wkkgz) een kwalitatieve raming uitgevoerd of de aanbevelingen mogelijk leiden tot substantiële financiële gevolgen. Bij het uitvoeren van deze beoordeling zijn richtlijnmodules op verschillende domeinen getoetst (zie het stroomschema op de Richtlijnendatabase).
Uit de kwalitatieve raming blijkt dat er geen substantiële financiële gevolgen zijn voor deze richtlijn, gezien het aantal patiënten kleiner is dan 5000 per jaar.
Werkwijze
AGREE
Deze richtlijnmodule is opgesteld conform de eisen vermeld in het rapport Medisch Specialistische Richtlijnen 2.0 van de adviescommissie Richtlijnen van de Raad Kwaliteit. Dit rapport is gebaseerd op het AGREE II instrument (Appraisal of Guidelines for Research & Evaluation II; Brouwers, 2010).
Knelpuntenanalyse en uitgangsvragen
Tijdens de voorbereidende fase inventariseerde de werkgroep de knelpunten in de zorg voor patiënten met PTO. De werkgroep beoordeelde de aanbeveling(en) uit de eerdere richtlijn PTO op noodzaak tot revisie. Tevens zijn er knelpunten aangedragen door de deelnemende WV-en, de V&VN en de patiëntorganisatie Missie Tumor Onbekend.
Op basis van de uitkomsten van de knelpuntenanalyse zijn door de werkgroep concept-uitgangsvragen opgesteld en definitief vastgesteld.
Uitkomstmaten
Na het opstellen van de zoekvraag behorende bij de uitgangsvraag inventariseerde de werkgroep welke uitkomstmaten voor de patiënt relevant zijn, waarbij zowel naar gewenste als ongewenste effecten werd gekeken. Hierbij werd een maximum van acht uitkomstmaten gehanteerd. De werkgroep waardeerde deze uitkomstmaten volgens hun relatieve belang bij de besluitvorming rondom aanbevelingen, als cruciaal (kritiek voor de besluitvorming), belangrijk (maar niet cruciaal) en onbelangrijk. Tevens definieerde de werkgroep tenminste voor de cruciale uitkomstmaten welke verschillen zij klinisch (patiënt) relevant vonden.
Methode literatuursamenvatting
Een uitgebreide beschrijving van de strategie voor zoeken en selecteren van literatuur is te vinden onder ‘Zoeken en selecteren’ onder Onderbouwing. Indien mogelijk werden de data uit verschillende studies gepoold in een random-effects model. Review Manager 5.4 werd gebruikt voor de statistische analyses. De beoordeling van de kracht van het wetenschappelijke bewijs wordt hieronder toegelicht.
Beoordelen van de kracht van het wetenschappelijke bewijs
De kracht van het wetenschappelijke bewijs werd bepaald volgens de GRADE-methode. GRADE staat voor ‘Grading Recommendations Assessment, Development and Evaluation’ (zie http://www.gradeworkinggroup.org/). De basisprincipes van de GRADE-methodiek zijn: het benoemen en prioriteren van de klinisch (patiënt) relevante uitkomstmaten, een systematische review per uitkomstmaat, en een beoordeling van de bewijskracht per uitkomstmaat op basis van de acht GRADE-domeinen (domeinen voor downgraden: risk of bias, inconsistentie, indirectheid, imprecisie, en publicatiebias; domeinen voor upgraden: dosis-effect relatie, groot effect, en residuele plausibele confounding).
GRADE onderscheidt vier gradaties voor de kwaliteit van het wetenschappelijk bewijs: hoog, redelijk, laag en zeer laag. Deze gradaties verwijzen naar de mate van zekerheid die er bestaat over de literatuurconclusie, in het bijzonder de mate van zekerheid dat de literatuurconclusie de aanbeveling adequaat ondersteunt (Schünemann, 2013; Hultcrantz, 2017).
|
GRADE |
Definitie |
|
Hoog |
|
|
Redelijk |
|
|
Laag |
|
|
Zeer laag |
|
Bij het beoordelen (graderen) van de kracht van het wetenschappelijk bewijs in richtlijnen volgens de GRADE-methodiek spelen grenzen voor klinische besluitvorming een belangrijke rol (Hultcrantz, 2017). Dit zijn de grenzen die bij overschrijding aanleiding zouden geven tot een aanpassing van de aanbeveling. Om de grenzen voor klinische besluitvorming te bepalen moeten alle relevante uitkomstmaten en overwegingen worden meegewogen. De grenzen voor klinische besluitvorming zijn daarmee niet één op één vergelijkbaar met het minimaal klinisch relevant verschil (Minimal Clinically Important Difference, MCID). Met name in situaties waarin een interventie geen belangrijke nadelen heeft en de kosten relatief laag zijn, kan de grens voor klinische besluitvorming met betrekking tot de effectiviteit van de interventie bij een lagere waarde (dichter bij het nuleffect) liggen dan de MCID (Hultcrantz, 2017).
Overwegingen (van bewijs naar aanbeveling)
Om te komen tot een aanbeveling zijn naast (de kwaliteit van) het wetenschappelijke bewijs ook andere aspecten belangrijk en worden meegewogen, zoals aanvullende argumenten uit bijvoorbeeld de biomechanica of fysiologie, waarden en voorkeuren van patiënten, kosten (middelenbeslag), aanvaardbaarheid, haalbaarheid en implementatie. Deze aspecten zijn systematisch vermeld en beoordeeld (gewogen) onder het kopje ‘Overwegingen’ en kunnen (mede) gebaseerd zijn op expert opinion. Hierbij is gebruik gemaakt van een gestructureerd format gebaseerd op het evidence-to-decision framework van de internationale GRADE Working Group (Alonso-Coello, 2016a; Alonso-Coello, 2016b). Dit evidence-to-decision framework is een integraal onderdeel van de GRADE methodiek.
Formuleren van aanbevelingen
De aanbevelingen geven antwoord op de uitgangsvraag en zijn gebaseerd op het beschikbare wetenschappelijke bewijs en de belangrijkste overwegingen, en een weging van de gunstige en ongunstige effecten van de relevante interventies. De kracht van het wetenschappelijk bewijs en het gewicht dat door de werkgroep wordt toegekend aan de overwegingen, bepalen samen de sterkte van de aanbeveling. Conform de GRADE-methodiek sluit een lage bewijskracht van conclusies in de systematische literatuuranalyse een sterke aanbeveling niet a priori uit, en zijn bij een hoge bewijskracht ook zwakke aanbevelingen mogelijk (Agoritsas, 2017; Neumann, 2016). De sterkte van de aanbeveling wordt altijd bepaald door weging van alle relevante argumenten tezamen. De werkgroep heeft bij elke aanbeveling opgenomen hoe zij tot de richting en sterkte van de aanbeveling zijn gekomen.
In de GRADE-methodiek wordt onderscheid gemaakt tussen sterke en zwakke (of conditionele) aanbevelingen. De sterkte van een aanbeveling verwijst naar de mate van zekerheid dat de voordelen van de interventie opwegen tegen de nadelen (of vice versa), gezien over het hele spectrum van patiënten waarvoor de aanbeveling is bedoeld. De sterkte van een aanbeveling heeft duidelijke implicaties voor patiënten, behandelaars en beleidsmakers (zie onderstaande tabel). Een aanbeveling is geen dictaat, zelfs een sterke aanbeveling gebaseerd op bewijs van hoge kwaliteit (GRADE-gradering HOOG) zal niet altijd van toepassing zijn, onder alle mogelijke omstandigheden en voor elke individuele patiënt.
|
Implicaties van sterke en zwakke aanbevelingen voor verschillende richtlijngebruikers |
||
|
|
Sterke aanbeveling |
Zwakke (conditionele) aanbeveling |
|
Voor patiënten |
De meeste patiënten zouden de aanbevolen interventie of aanpak kiezen en slechts een klein aantal niet. |
Een aanzienlijk deel van de patiënten zouden de aanbevolen interventie of aanpak kiezen, maar veel patiënten ook niet. |
|
Voor behandelaars |
De meeste patiënten zouden de aanbevolen interventie of aanpak moeten ontvangen. |
Er zijn meerdere geschikte interventies of aanpakken. De patiënt moet worden ondersteund bij de keuze voor de interventie of aanpak die het beste aansluit bij zijn of haar waarden en voorkeuren. |
|
Voor beleidsmakers |
De aanbevolen interventie of aanpak kan worden gezien als standaardbeleid. |
Beleidsbepaling vereist uitvoerige discussie met betrokkenheid van veel stakeholders. Er is een grotere kans op lokale beleidsverschillen. |
Organisatie van zorg
In de knelpuntenanalyse en bij de ontwikkeling van de richtlijnmodule is expliciet aandacht geweest voor de organisatie van zorg: alle aspecten die randvoorwaardelijk zijn voor het verlenen van zorg (zoals coördinatie, communicatie, (financiële) middelen, mankracht en infrastructuur). Randvoorwaarden die relevant zijn voor het beantwoorden van deze specifieke uitgangsvraag zijn genoemd bij de overwegingen. Meer algemene, overkoepelende, of bijkomende aspecten van de organisatie van zorg worden behandeld in de module Organisatie van zorg.
Commentaar- en autorisatiefase
De conceptrichtlijnmodule werd aan de betrokken (wetenschappelijke) verenigingen en (patiënt) organisaties voorgelegd ter commentaar. De commentaren werden verzameld en besproken met de werkgroep. Naar aanleiding van de commentaren werd de conceptrichtlijnmodule aangepast en definitief vastgesteld door de werkgroep. De definitieve richtlijnmodule werd aan de deelnemende (wetenschappelijke) verenigingen en (patiënt) organisaties voorgelegd voor autorisatie en door hen geautoriseerd dan wel geaccordeerd.
Literatuur
Agoritsas T, Merglen A, Heen AF, Kristiansen A, Neumann I, Brito JP, Brignardello-Petersen R, Alexander PE, Rind DM, Vandvik PO, Guyatt GH. UpToDate adherence to GRADE criteria for strong recommendations: an analytical survey. BMJ Open. 2017 Nov 16;7(11):e018593. doi: 10.1136/bmjopen-2017-018593. PubMed PMID: 29150475; PubMed Central PMCID: PMC5701989.
Alonso-Coello P, Schünemann HJ, Moberg J, Brignardello-Petersen R, Akl EA, Davoli M, Treweek S, Mustafa RA, Rada G, Rosenbaum S, Morelli A, Guyatt GH, Oxman AD; GRADE Working Group. GRADE Evidence to Decision (EtD) frameworks: a systematic and transparent approach to making well informed healthcare choices. 1: Introduction. BMJ. 2016 Jun 28;353:i2016. doi: 10.1136/bmj.i2016. PubMed PMID: 27353417.
Alonso-Coello P, Oxman AD, Moberg J, Brignardello-Petersen R, Akl EA, Davoli M, Treweek S, Mustafa RA, Vandvik PO, Meerpohl J, Guyatt GH, Schünemann HJ; GRADE Working Group. GRADE Evidence to Decision (EtD) frameworks: a systematic and transparent approach to making well informed healthcare choices. 2: Clinical practice guidelines. BMJ. 2016 Jun 30;353:i2089. doi: 10.1136/bmj.i2089. PubMed PMID: 27365494.
Brouwers MC, Kho ME, Browman GP, Burgers JS, Cluzeau F, Feder G, Fervers B, Graham ID, Grimshaw J, Hanna SE, Littlejohns P, Makarski J, Zitzelsberger L; AGREE Next Steps Consortium. AGREE II: advancing guideline development, reporting and evaluation in health care. CMAJ. 2010 Dec 14;182(18):E839-42. doi: 10.1503/cmaj.090449. Epub 2010 Jul 5. Review. PubMed PMID: 20603348; PubMed Central PMCID: PMC3001530.
Hultcrantz M, Rind D, Akl EA, Treweek S, Mustafa RA, Iorio A, Alper BS, Meerpohl JJ, Murad MH, Ansari MT, Katikireddi SV, Östlund P, Tranæus S, Christensen R, Gartlehner G, Brozek J, Izcovich A, Schünemann H, Guyatt G. The GRADE Working Group clarifies the construct of certainty of evidence. J Clin Epidemiol. 2017 Jul;87:4-13. doi: 10.1016/j.jclinepi.2017.05.006. Epub 2017 May 18. PubMed PMID: 28529184; PubMed Central PMCID: PMC6542664.
Medisch Specialistische Richtlijnen 2.0 (2012). Adviescommissie Richtlijnen van de Raad Kwalitieit. http://richtlijnendatabase.nl/over_deze_site/over_richtlijnontwikkeling.html
Neumann I, Santesso N, Akl EA, Rind DM, Vandvik PO, Alonso-Coello P, Agoritsas T, Mustafa RA, Alexander PE, Schünemann H, Guyatt GH. A guide for health professionals to interpret and use recommendations in guidelines developed with the GRADE approach. J Clin Epidemiol. 2016 Apr;72:45-55. doi: 10.1016/j.jclinepi.2015.11.017. Epub 2016 Jan 6. Review. PubMed PMID: 26772609.
Schünemann H, Brożek J, Guyatt G, et al. GRADE handbook for grading quality of evidence and strength of recommendations. Updated October 2013. The GRADE Working Group, 2013. Available from http://gdt.guidelinedevelopment.org/central_prod/_design/client/handbook/handbook.html.
Zoekverantwoording
Algemene informatie
|
Richtlijn: Primaire Tumor Onbekend |
|
|
Uitgangsvraag: UV6 Pathologie – moleculaire diagnostiek voor identificatie primaire origine |
|
|
Database(s): Ovid/Medline, Embase |
Datum: 9-1-12023 |
|
Periode: 2010- |
Talen: nvt |
|
Literatuurspecialist: Ingeborg van Dusseldorp |
|
|
BMI zoekblokken: voor verschillende opdrachten wordt (deels) gebruik gemaakt van de zoekblokken van BMI-Online https://blocks.bmi-online.nl/ Bij gebruikmaking van een volledig zoekblok zal naar de betreffende link op de website worden verwezen. |
|
|
Toelichting: Voor deze vraag is gezocht met de volgende concepten: Primaire tumor onbekend EN moleculaire diagnostiek Van de zeven sleutelartikelen wordt 1 publicatie niet gevonden omdat het een conference paper betreft. Schipper LJSP, et al. 1133P Whole genome sequencing can classify diagnostically challenging tumors ESMO congress 2021 abstract book. Ann Oncol 2021; 32: S924–S925. (conference paper)
Het artikel van Schipper is inmiddels gepubliceerd en wordt gevonden.
|
|
|
Te gebruiken voor richtlijnen tekst: In de databases Embase en Ovid/Medline is op 9-1-2023 systematisch gezocht naar studies over de moleculaire diagnostiek voor de identificatie primaire origine. De literatuurzoekactie leverde 636 unieke treffers op. |
|
Zoekopbrengst
|
|
EMBASE |
OVID/MEDLINE |
Ontdubbeld |
|
SRs |
20 |
11 |
25 |
|
RCTs |
79 |
26 |
83 |
|
Observationele studies |
240 |
127 |
271 |
|
Overig |
228 |
247 |
257 |
|
Totaal |
|
|
636 |
Zoekstrategie
Embase
|
No. |
Query |
Results |
|
#28 |
#12 AND #28 Artikel Schipper gevonden |
1 |
|
#27 |
'complete genomic characterization in patients with cancer of unknown primary origin in routine diagnostics' |
1 |
|
#26 |
schipper AND whole AND genome AND sequencing |
20 |
|
#25 |
#12 NOT #21 NOT #20 NOT #19 Overige |
228 |
|
#24 |
#19 OR #20 OR #21 |
339 |
|
#23 |
#21 NOT #20 NOT #19 OBS |
240 |
|
#22 |
#20 NOT #19RCT |
79 |
|
#21 |
#12 AND (#17 OR #18) |
302 |
|
#20 |
#12 AND #16 |
79 |
|
#19 |
#12 AND #15 SR |
20 |
|
#18 |
'case control study'/de OR 'comparative study'/exp OR 'control group'/de OR 'controlled study'/de OR 'controlled clinical trial'/de OR 'crossover procedure'/de OR 'double blind procedure'/de OR 'phase 2 clinical trial'/de OR 'phase 3 clinical trial'/de OR 'phase 4 clinical trial'/de OR 'pretest posttest design'/de OR 'pretest posttest control group design'/de OR 'quasi experimental study'/de OR 'single blind procedure'/de OR 'triple blind procedure'/de OR (((control OR controlled) NEAR/6 trial):ti,ab,kw) OR (((control OR controlled) NEAR/6 (study OR studies)):ti,ab,kw) OR (((control OR controlled) NEAR/1 active):ti,ab,kw) OR 'open label*':ti,ab,kw OR (((double OR two OR three OR multi OR trial) NEAR/1 (arm OR arms)):ti,ab,kw) OR ((allocat* NEAR/10 (arm OR arms)):ti,ab,kw) OR placebo*:ti,ab,kw OR 'sham-control*':ti,ab,kw OR (((single OR double OR triple OR assessor) NEAR/1 (blind* OR masked)):ti,ab,kw) OR nonrandom*:ti,ab,kw OR 'non-random*':ti,ab,kw OR 'quasi-experiment*':ti,ab,kw OR crossover:ti,ab,kw OR 'cross over':ti,ab,kw OR 'parallel group*':ti,ab,kw OR 'factorial trial':ti,ab,kw OR ((phase NEAR/5 (study OR trial)):ti,ab,kw) OR ((case* NEAR/6 (matched OR control*)):ti,ab,kw) OR ((match* NEAR/6 (pair OR pairs OR cohort* OR control* OR group* OR healthy OR age OR sex OR gender OR patient* OR subject* OR participant*)):ti,ab,kw) OR ((propensity NEAR/6 (scor* OR match*)):ti,ab,kw) OR versus:ti OR vs:ti OR compar*:ti OR ((compar* NEAR/1 study):ti,ab,kw) OR (('major clinical study'/de OR 'clinical study'/de OR 'cohort analysis'/de OR 'observational study'/de OR 'cross-sectional study'/de OR 'multicenter study'/de OR 'correlational study'/de OR 'follow up'/de OR cohort*:ti,ab,kw OR 'follow up':ti,ab,kw OR followup:ti,ab,kw OR longitudinal*:ti,ab,kw OR prospective*:ti,ab,kw OR retrospective*:ti,ab,kw OR observational*:ti,ab,kw OR 'cross sectional*':ti,ab,kw OR cross?ectional*:ti,ab,kw OR multicent*:ti,ab,kw OR 'multi-cent*':ti,ab,kw OR consecutive*:ti,ab,kw) AND (group:ti,ab,kw OR groups:ti,ab,kw OR subgroup*:ti,ab,kw OR versus:ti,ab,kw OR vs:ti,ab,kw OR compar*:ti,ab,kw OR 'odds ratio*':ab OR 'relative odds':ab OR 'risk ratio*':ab OR 'relative risk*':ab OR 'rate ratio':ab OR aor:ab OR arr:ab OR rrr:ab OR ((('or' OR 'rr') NEAR/6 ci):ab))) |
13679059 |
|
#17 |
'major clinical study'/de OR 'clinical study'/de OR 'case control study'/de OR 'family study'/de OR 'longitudinal study'/de OR 'retrospective study'/de OR 'prospective study'/de OR 'comparative study'/de OR 'cohort analysis'/de OR ((cohort NEAR/1 (study OR studies)):ab,ti) OR (('case control' NEAR/1 (study OR studies)):ab,ti) OR (('follow up' NEAR/1 (study OR studies)):ab,ti) OR (observational NEAR/1 (study OR studies)) OR ((epidemiologic NEAR/1 (study OR studies)):ab,ti) OR (('cross sectional' NEAR/1 (study OR studies)):ab,ti) |
6767914 |
|
#16 |
'clinical trial'/exp OR 'randomization'/exp OR 'single blind procedure'/exp OR 'double blind procedure'/exp OR 'crossover procedure'/exp OR 'placebo'/exp OR 'prospective study'/exp OR rct:ab,ti OR random*:ab,ti OR 'single blind':ab,ti OR 'randomised controlled trial':ab,ti OR 'randomized controlled trial'/exp OR placebo*:ab,ti |
3302394 |
|
#15 |
'meta analysis'/exp OR 'meta analysis (topic)'/exp OR metaanaly*:ti,ab OR 'meta analy*':ti,ab OR metanaly*:ti,ab OR 'systematic review'/de OR 'cochrane database of systematic reviews'/jt OR prisma:ti,ab OR prospero:ti,ab OR (((systemati* OR scoping OR umbrella OR 'structured literature') NEAR/3 (review* OR overview*)):ti,ab) OR ((systemic* NEAR/1 review*):ti,ab) OR (((systemati* OR literature OR database* OR 'data base*') NEAR/10 search*):ti,ab) OR (((structured OR comprehensive* OR systemic*) NEAR/3 search*):ti,ab) OR (((literature NEAR/3 review*):ti,ab) AND (search*:ti,ab OR database*:ti,ab OR 'data base*':ti,ab)) OR (('data extraction':ti,ab OR 'data source*':ti,ab) AND 'study selection':ti,ab) OR ('search strategy':ti,ab AND 'selection criteria':ti,ab) OR ('data source*':ti,ab AND 'data synthesis':ti,ab) OR medline:ab OR pubmed:ab OR embase:ab OR cochrane:ab OR (((critical OR rapid) NEAR/2 (review* OR overview* OR synthes*)):ti) OR ((((critical* OR rapid*) NEAR/3 (review* OR overview* OR synthes*)):ab) AND (search*:ab OR database*:ab OR 'data base*':ab)) OR metasynthes*:ti,ab OR 'meta synthes*':ti,ab |
733409 |
|
#14 |
#8 NOT #12 |
1 |
|
#13 |
#8 AND #12 |
6 |
|
#12 |
#11 AND [1-1-2010]/sd NOT ('conference abstract'/it OR 'editorial'/it OR 'letter'/it OR 'note'/it) NOT (('animal'/exp OR 'animal experiment'/exp OR 'animal model'/exp OR 'nonhuman'/exp) NOT 'human'/exp) |
567 |
|
#11 |
#9 AND #10 |
1053 |
|
#10 |
'rna sequencing'/exp OR 'molecular diagnostics'/exp/mj OR 'molecular diagnosis'/exp/mj OR 'gene expression profiling'/exp OR 'whole genome sequencing'/exp OR 'high throughput sequencing'/de OR 'wes analys*':ti,ab,kw OR (((exom* OR genome* OR 'high throughput' OR 'next generation') NEAR/2 (sequenc* OR profil* OR landscape*)):ti,ab,kw) OR 'wgs analys*':ti,ab,kw OR 'comprehensive genomic profiling'/exp OR (((expres* OR product* OR set) NEAR/3 gene* NEAR/3 (analys* OR profile* OR kit OR test OR testing OR tests)):ti,ab,kw) OR 'mutational profil*':ti,ab,kw OR 'rna seq*':ti,ab,kw OR rnaseq*:ti,ab,kw OR (((methylation OR epigen*) NEAR/3 profil*):ti,ab,kw) OR tso500:ti,ab,kw OR 'tso 500':ti,ab,kw OR ((molecular NEAR/2 (diagnos* OR genetic*)):ti,ab,kw) OR 'somatic mutation':ti,ab,kw |
721096 |
|
#9 |
(((unknown OR undetermined OR unidentified OR undefined) NEAR/2 (primar* OR origin*)):ti,ab,kw) AND ('cancer'/exp OR cancer*:ti,ab,kw OR neoplasm*:ti,ab,kw OR tumo*:ti,ab,kw OR carcinoma*:ti,ab,kw OR adeno*:ti,ab,kw OR metasta*:ti,ab,kw OR micrometasta*:ti,ab,kw OR malignan*:ti,ab,kw OR lymphoma*:ti,ab,kw OR sarcoma*:ti,ab,kw OR melanoma*:ti,ab,kw) OR 'cancer of unknown primary site'/exp OR ((occult NEAR/3 (cancer* OR neoplasm* OR tumo* OR carcinoma* OR adeno* OR metasta* OR micrometasta* OR malignan* OR lymphoma* OR sarcoma* OR melanoma*)):ti,ab,kw) |
28709 |
|
#8 |
#1 OR #2 OR #3 OR #4 OR #5 OR #6 OR #7 sleutelartikelen |
7 |
|
#7 |
mining AND mutation AND contexts AND across AND the AND cancer AND genome AND to AND map AND tumor AND site AND of AND origin |
1 |
|
#6 |
evaluating AND dna AND methylation, AND gene AND expression, AND somatic AND mutation, AND their AND combinations AND in AND inferring AND tumor AND 'tissue of origin' |
1 |
|
#5 |
molecular AND gene AND expression AND profiling AND to AND predict AND tissue AND origin AND direct AND 'site specific' AND therapy AND in AND patients AND with AND carcinoma AND unknown AND primary AND site AND a AND prospective AND trial AND of AND the AND sarah AND cannon AND research AND institute AND hainsworth NOT scri |
1 |
|
#4 |
tumortracer AND method AND to AND identify AND tissue AND origin AND from AND the AND somatic AND mutations AND of AND a AND tumor AND specimen |
1 |
|
#3 |
a AND tool AND for AND inferring AND cancer AND tissue AND of AND origin AND molecular AND subtype AND using AND rna AND 'gene expression' AND data AND artificial AND intelligence |
1 |
|
#2 |
whole AND genome AND sequencing AND can AND classify AND diagnostically AND challenging AND tumors AND schipper |
1 |
|
#1 |
machine AND 'learning based' AND tissue AND origin AND classification AND for AND cancer AND of AND unknown AND primary AND diagnostics AND using AND 'genome wide' AND mutation AND features NOT schipper |
1 |
Ovid/Medline
|
# |
Searches |
Results |
|
15 |
5 not 12 not 11 not 10 Overige |
247 |
|
14 |
12 not 11 not 10 OBS |
127 |
|
13 |
11 not 10 RCT |
26 |
|
12 |
5 and (8 or 9) |
143 |
|
11 |
5 and 7 |
27 |
|
10 |
5 and 6 SR |
11 |
|
9 |
Case-control Studies/ or clinical trial, phase ii/ or clinical trial, phase iii/ or clinical trial, phase iv/ or comparative study/ or control groups/ or controlled before-after studies/ or controlled clinical trial/ or double-blind method/ or historically controlled study/ or matched-pair analysis/ or single-blind method/ or (((control or controlled) adj6 (study or studies or trial)) or (compar* adj (study or studies)) or ((control or controlled) adj1 active) or "open label*" or ((double or two or three or multi or trial) adj (arm or arms)) or (allocat* adj10 (arm or arms)) or placebo* or "sham-control*" or ((single or double or triple or assessor) adj1 (blind* or masked)) or nonrandom* or "non-random*" or "quasi-experiment*" or "parallel group*" or "factorial trial" or "pretest posttest" or (phase adj5 (study or trial)) or (case* adj6 (matched or control*)) or (match* adj6 (pair or pairs or cohort* or control* or group* or healthy or age or sex or gender or patient* or subject* or participant*)) or (propensity adj6 (scor* or match*))).ti,ab,kf. or (confounding adj6 adjust*).ti,ab. or (versus or vs or compar*).ti. or ((exp cohort studies/ or epidemiologic studies/ or multicenter study/ or observational study/ or seroepidemiologic studies/ or (cohort* or 'follow up' or followup or longitudinal* or prospective* or retrospective* or observational* or multicent* or 'multi-cent*' or consecutive*).ti,ab,kf.) and ((group or groups or subgroup* or versus or vs or compar*).ti,ab,kf. or ('odds ratio*' or 'relative odds' or 'risk ratio*' or 'relative risk*' or aor or arr or rrr).ab. or (("OR" or "RR") adj6 CI).ab.)) |
5324402 |
|
8 |
Epidemiologic studies/ or case control studies/ or exp cohort studies/ or Controlled Before-After Studies/ or Case control.tw. or cohort.tw. or Cohort analy$.tw. or (Follow up adj (study or studies)).tw. or (observational adj (study or studies)).tw. or Longitudinal.tw. or Retrospective*.tw. or prospective*.tw. or consecutive*.tw. or Cross sectional.tw. or Cross-sectional studies/ or historically controlled study/ or interrupted time series analysis/ [Onder exp cohort studies vallen ook longitudinale, prospectieve en retrospectieve studies] |
4330206 |
|
7 |
exp randomized controlled trial/ or randomized controlled trials as topic/ or random*.ti,ab. or rct?.ti,ab. or ((pragmatic or practical) adj "clinical trial*").ti,ab,kf. or ((non-inferiority or noninferiority or superiority or equivalence) adj3 trial*).ti,ab,kf. |
1574889 |
|
6 |
meta-analysis/ or meta-analysis as topic/ or (metaanaly* or meta-analy* or metanaly*).ti,ab,kf. or systematic review/ or cochrane.jw. or (prisma or prospero).ti,ab,kf. or ((systemati* or scoping or umbrella or "structured literature") adj3 (review* or overview*)).ti,ab,kf. or (systemic* adj1 review*).ti,ab,kf. or ((systemati* or literature or database* or data-base*) adj10 search*).ti,ab,kf. or ((structured or comprehensive* or systemic*) adj3 search*).ti,ab,kf. or ((literature adj3 review*) and (search* or database* or data-base*)).ti,ab,kf. or (("data extraction" or "data source*") and "study selection").ti,ab,kf. or ("search strategy" and "selection criteria").ti,ab,kf. or ("data source*" and "data synthesis").ti,ab,kf. or (medline or pubmed or embase or cochrane).ab. or ((critical or rapid) adj2 (review* or overview* or synthes*)).ti. or (((critical* or rapid*) adj3 (review* or overview* or synthes*)) and (search* or database* or data-base*)).ab. or (metasynthes* or meta-synthes*).ti,ab,kf. |
639972 |
|
5 |
4 not ((exp animals/ or exp models, animal/) not humans/) not (letter/ or comment/ or editorial/) |
411 |
|
4 |
limit 3 to yr="2010 -Current" |
435 |
|
3 |
1 and 2 |
548 |
|
2 |
High-Throughput Nucleotide Sequencing/ or Sequence Analysis, RNA/ or Pathology, Molecular/ or exp Gene Expression Profiling/ or exp Whole Genome Sequencing/ or wes analys*.ti,ab,kf. or ((exom* or genome* or high throughput or next generation) adj2 (sequenc* or profil* or landscape*)).ti,ab,kf. or wgs analys*.ti,ab,kf. or ((expres* or product* or set) adj3 gene* adj3 (analys* or profile* or kit or test or testing or tests)).ti,ab,kf. or mutational profil*.ti,ab,kf. or rna seq*.ti,ab,kf. or rnaseq*.ti,ab,kf. or ((methylation or epigen*) adj3 profil*).ti,ab,kf. or tso500.ti,ab,kf. or tso 500.ti,ab,kf. or (molecular adj2 (diagnos* or genetic*)).ti,ab,kf. or somatic mutation.ti,ab,kf. |
551643 |
|
1 |
(((unknown or undetermined or unidentified or undefined) adj2 (primar* or origin*)).ti,ab,kf. and (exp Neoplasms/ or cancer*.ti,ab,kf. or neoplasm*.ti,ab,kf. or tumo*.ti,ab,kf. or carcinoma*.ti,ab,kf. or adeno*.ti,ab,kf. or metasta*.ti,ab,kf. or micrometasta*.ti,ab,kf. or malignan*.ti,ab,kf. or lymphoma*.ti,ab,kf. or sarcoma*.ti,ab,kf. or melanoma*.ti,ab,kf.)) or (occult adj3 (cancer* or neoplasm* or tumo* or carcinoma* or adeno* or metasta* or micrometasta* or malignan* or lymphoma* or sarcoma* or melanoma*)).ti,ab,kf. or Neoplasms, Unknown Primary/ |
19443 |